matlab.engine 的导入在 IPython 中有效，但在 Jupyter 中无效

Question

我刚刚使用

将 Python 的 MATLAB 引擎 API 安装到我的主目录

$ python setup.py build --build-base=$HOME install --prefix=$HOME

但是，当我尝试从 Jupyter notebook import matlab.engine 时，出现以下错误：

---------------------------------------------------------------------------
EnvironmentError                          Traceback (most recent call last)
<ipython-input-2-833daa01cd46> in <module>()
      8 import numpy as np
      9 import matplotlib.pyplot as plt
---> 10 import matlab.engine
     11 
     12 from dopa_net.behavioral_experiments.analysis_code import behavior_analysis as ba

/home/despo/dbliss/lib/matlab/engine/__init__.py in <module>()
     57         pythonengine = importlib.import_module("matlabengineforpython"+_PYTHONVERSION)
     58     except:
---> 59         raise EnvironmentError('The installation of MATLAB Engine for Python is '
     60                                 'corrupted.  Please reinstall it or contact '
     61                                 'MathWorks Technical Support for assistance.')

EnvironmentError: The installation of MATLAB Engine for Python is corrupted.  Please reinstall it or contact MathWorks Technical Support for assistance.

奇怪的是，当我 import matlab.engine 从 IPython shell 与 Jupyter 笔记本 [=40] 相同的目录中时，我没有收到此错误=].我不仅可以从 shell 导入引擎——它在 shell 中工作，这向我证明没有任何损坏：

In [1]: import matlab.engine In [2]: eng = matlab.engine.start_matlab() In [3]: tf = eng.isprime(37) In [4]: print tf True

有什么想法吗？

N.B。我今天早些时候确实在我的主目录中安装了一个版本的引擎，但我试图（并且认为我已经）卸载它。我的猜测是它的一部分被遗忘并造成了麻烦。但为什么它只给 Jupyter 带来麻烦，而不给 IPython shell 带来麻烦？（你认为我应该如何摆脱它？）

更新

我将错误跟踪到 matlab.engine 模块的 __init__.py 文件中的以下行：

importlib.import_module("matlabengineforpython2_7")

不会在 IPython shell 中引发错误，但会在 Jupyter 中引发以下错误：

--------------------------------------------------------------------------- ImportError Traceback (most recent call last) <ipython-input-4-831d184262c4> in <module>() ----> 1 importlib.import_module("matlabengineforpython2_7") /usr/local/anaconda-2.4.0/lib/python2.7/importlib/__init__.pyc in import_module(name, package) 35 level += 1 36 name = _resolve_name(name[level:], package, level) ---> 37 __import__(name) 38 return sys.modules[name] ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.15' not found (required by /srv/local/matlab-2015a/extern/engines/python/dist/matlab/engine/glnxa64/../../../../../../../bin/glnxa64/libmwfl.so)

我不知道这里发生了什么。

Answer 1

IPython Shell 和 Jupyter Notebook 无法访问相同的 C 库的假设似乎是正确的。为什么会这样，我不知道。两者作为同一个包的一部分安装，使用相同版本Python，等等

将以下行添加到我的 .bashrc shell 配置文件中解决了问题：

export LD_LIBRARY_PATH=XXX

其中 XXX 是包含我希望 Jupyter Notebook 使用的 libstdc++.so.6 版本的目录（并且 IPython Shell 已经使用）。

matlab.engine 的导入在 IPython 中有效，但在 Jupyter 中无效

Import of matlab.engine works in IPython but not in Jupyter

python

matlab

ipython

jupyter

jupyter-notebook

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