闪亮的应用程序 rglwidget 获取 userMatrix 以生成另一个具有相同旋转的图

shiny app rglwidget get userMatrix to generate another plot with same rotation

我有一个闪亮的应用程序并在其中集成了一个 rgl 3d-plot。我正在使用 rglwidget 包中的 renderRglwidget 将使用 webgl 的 rgl 图形插入到我闪亮的应用程序中。

在应用程序中,用户可以旋转图形。现在我想保存旋转状态,因此 userMatrix 或 modelMatrix 稍后会生成一个类似的图,其旋转与用户离开上一个图形时的旋转相同。

Here 我读了一些关于 java 存储 userMatrix 和其他参数的变量。我可以从我闪亮的应用程序中访问它们吗(在 R 代码中)?

在 rgl 本身,我可以使用 rotationMatrix <- rgl.projection()$modelrotationMatrix <- par3d()$modelMatrix 来存储模型的旋转。但是因为在我的例子中图形没有在 rgl 本身中旋转,所以这些函数对我没有帮助。

我试过的是这样的:

library(shiny)
library(rgl)
library(rglwidget)

ui <- fluidPage(
  rglwidgetOutput("3D-plot"),
  actionButton("showMatrix", "show rotation Matrix")
)

server <- function(input, output, session){
  open3d(useNULL = T)
  x <- sort(rnorm(1000))
  y <- rnorm(1000)
  z <- rnorm(1000) + atan2(x, y)
  plot3d(x, y, z, col = rainbow(1000))
  scene1 <- scene3d()
  rgl.close()

  output$"3D-plot" <- renderRglwidget({
    rglwidget(scene1)
  })
  observe({
    input$showMatrix
    par3d()$modelMatrix
  })
}


shinyApp(ui=ui, server=server)

但是par3d()$modelMatrix似乎return什么都没有。

rgl:par3d() 没有 return 任何东西的原因是 rgl 包实际上并没有管理闪亮的场景。利用 WebGL 的基于 javascript 的 rglwidget 库正在管理它,您正在将场景复制到另一个非常兼容的 GL 库(也许他们甚至使用相同的编译库,但我怀疑它)并以闪亮的方式显示。所以rgl.dev()帮不了你。

AFAIK,获取这些值并不容易,因为它们隐藏在 rglwidget javascript 中,但我想获取它们,所以我构建了一个闪亮的自定义输入控件可以做到。这是一项相当大的工作量,而且可能有更简单的方法,但我没有看到它,至少我现在知道如何为 shiny 构建自定义输入控件。如果有人知道更简单的方法,请赐教。

这是 javascript,它进入一个 www 子文件夹,您将其保存在与闪亮代码相同的目录中。

rglwidgetaux.js

// rglwidgetaux control for querying shiny rglwiget

var rglwidgetauxBinding = new Shiny.InputBinding();
$.extend(rglwidgetauxBinding, {
  find: function(scope) {
    return $(scope).find(".rglWidgetAux");
  },
  getValue: function(el) {
    return el.value;
  },
  setValue: function(el, value) {
  //  $(el).text(value);
     el.value = value;
  },
  getState: function(el) {
    return { value: this.getValue(el) };
  },
   receiveMessage: function(el, data) {
    var $el = $(el);

    switch (data.cmd) {
       case "test":alert("Recieved Message");
                    break;
       case "getpar3d":
                    var rglel = $("#"+data.rglwidgetId);
                    if (rglel.length===0){
                       alert("bad rglwidgetId:"+ data.rglwidgetId);
                       return null;
                    }
                    var rglinst = rglel[0].rglinstance;
                    var sid = rglinst.scene.rootSubscene;
                    var par3d = rglinst.getObj(sid).par3d;
                    this.setValue(el,JSON.stringify(par3d));
                    $el.trigger("change"); // tell myself that I have changed
                    break;
    }
  },  
  subscribe: function(el, callback) {
    $(el).on("change.rglwidgetauxBinding", function(e) {
      callback();
    });
  },
  unsubscribe: function(el) {
    $(el).off(".rglwidgetauxBinding");
  }
});
Shiny.inputBindings.register(rglwidgetauxBinding);

这是 R/shiny 代码。它使用通常的测试场景并有一个按钮来查询场景 userMatrix 并将其显示在 table 中。我使用了 userMatrix 而不是 modelMatrix 因为前者很容易用鼠标改变,所以你可以看到你得到的是最新的值。

请注意名称 "app.R" 并不是可选的。要么你必须使用它,要么将文件拆分为 "ui.R" 和 "server.R",否则它不会导入上面的 javascript 文件。

app.R

library(shiny)
library(rgl)
library(htmlwidgets)
library(jsonlite)

rglwgtctrl <- function(inputId, value="", nrows, ncols) {
  # This code includes the javascript that we need and defines the html
  tagList(
    singleton(tags$head(tags$script(src = "rglwidgetaux.js"))),
    tags$div(id = inputId,class = "rglWidgetAux",as.character(value))
  )
}

ui <- fluidPage(
    rglwgtctrl('ctrlplot3d'),
    actionButton("regen", "Regen Scene"),
    actionButton("queryumat", "Query User Matrix"),
    rglwidgetOutput("plot3d"),
    tableOutput("usermatrix")
)

server <- function(input, output, session) 
{
  observe({
    # tell our rglWidgetAux to query the plot3d for its par3d
    input$queryumat
    session$sendInputMessage("ctrlplot3d",list("cmd"="getpar3d","rglwidgetId"="plot3d"))
  })

  output$usermatrix <- renderTable({
    # grab the user matrix from the par3d stored in our rglWidgetAux
    # note we are using two different "validate"s here, which is quite the pain if you 
    # don't notice that it is declared in two different libraries
    shiny::validate(need(!is.null(input$ctrlplot3d),"User Matrix not yet queried"))
    umat <- matrix(0,4,4)
    jsonpar3d <- input$ctrlplot3d
    if (jsonlite::validate(jsonpar3d)){
      par3dout <- fromJSON(jsonpar3d)
      umat <- matrix(unlist(par3dout$userMatrix),4,4) # make list into matrix
    }
    return(umat)
  })

  scenegen <- reactive({
     # make a random scene
     input$regen
     n <- 1000
     x <- sort(rnorm(n))
     y <- rnorm(n)
     z <- rnorm(n) + atan2(x, y)
     plot3d(x, y, z, col = rainbow(n))
     scene1 <- scene3d()
     rgl.close() # make the app window go away
     return(scene1)
  })
  output$plot3d <- renderRglwidget({ rglwidget(scenegen()) })
}

shinyApp(ui=ui, server=server)

最后是它的样子:

请注意,我对其进行了设置,以便您可以向其中添加命令,您可以(可能)更改参数以及基于此控件的控件的任何其他内容。

还要注意这里的par3d结构(转换为json然后从rglwidgetjavascript转换为R)和rgl中的结构不是完全相同,所以例如我不得不展平 userMatrix 因为 WebGL 似乎更喜欢它作为名称列表而不是按预期出现的其他矩阵。