在 R 中批处理一次读取多个文件

Question

我有 100 个文件想通过 R 运行进行分析。我的一些代码使用单个文件，我发现我可以使用以下代码对它们进行批处理

setwd("~/directory of interest")
files <- list.files(pattern = "*.csv$")
files

for(i in 1:length(files)){
DataSet1 <- read.csv(file = files[i], header = TRUE, stringsAsFactors = TRUE)
do my algorithum
setwd("~/location of saving directory")
write.csv(DataSet1, file = files[i], quote = FALSE, row.names = FALSE)
setwd("~/directory of interest")}

我有另一个分析，其中我有 2 个文件（一对）都需要作为两个不同的数据集读入，然后我的算法可以运行。有没有办法以批处理格式执行此操作。我的文件被命名为它们总是彼此相邻，（也就是当文件在我的 WD 中被识别时，它们应该是 DataSet1a、DataSet1b、DataSet2a、DataSet2b 等）因为我有 100 对文件我可以做它们一次手动一对，但我觉得必须有更好的方法。谢谢

Answer 1

您可以尝试类似的方法：

setwd("~/directory of interest")
filesA <- list.files(pattern = "*a.csv$")
filesB <- list.files(pattern = "*b.csv$")

for(i in 1:length(filesA)){
    DataSet1A <- read.csv(file = filesA[i], header = TRUE, stringsAsFactors = TRUE)
    DataSet1B <- read.csv(file = filesB[i], header = TRUE, stringsAsFactors = TRUE)
    ...
}

在 R 中批处理一次读取多个文件

batching in R reading in multiple files at a time

r

batch-processing