SLURM squeue 格式参数从 subprocess.Popen 开始失败

Question

我正在尝试从 python 脚本调用 SLURM squeue。命令，

/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft

在命令行中工作正常，但在 subprocess.Popen 中失败：

    p = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
  File "/n/home00/DilithiumMatrix/.conda/envs/py35/lib/python3.5/subprocess.py", line 947, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "/n/home00/DilithiumMatrix/.conda/envs/py35/lib/python3.5/subprocess.py", line 1551, in _execute_child
    raise child_exception_type(errno_num, err_msg)
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft'

MWE:

import subprocess
command = "/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft"
p = subprocess.Popen(command, stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
text = p.stdout.read()
print(text)

/usr/bin/squeue 从命令行或 Popen.

都可以正常工作

它是否会失败，因为它需要一些关于正在执行 squeue 命令的 user/group 的信息，并且当运行通过 python 时，这些信息（不知何故）丢失了？还有什么可能导致这种情况？

Answer 1

subprocess.Popen 的第一个参数是字符串或字符串列表。如果它是单个字符串，它将被解释为文件名。这就是您收到错误的原因。要传递字符串列表，它应该与 shell 将您的参数传递给进程的方式相匹配。标准的 shell 会用空格分割你的命令行，所以不要这样：

command = "/usr/bin/squeue --Format=username,jobid,name,timeleft"

你需要这个：

command = ["/usr/bin/squeue", "--Format=username,jobid,name,timeleft"]

正如您在评论中提到的那样，在“=”处拆分第二个参数只会混淆 squeue，然后它会看到两个参数。

SLURM squeue 格式参数从 subprocess.Popen 开始失败

SLURM squeue format argument fails from subprocess.Popen

python

jobs

command-line

subprocess

slurm