如何在 Slurm 批处理文件中声明变量并在 multiprog conf 中使用它？

Question

在我当前的项目中，我遇到了 slurm multiprog conf 中超长命令的问题（它有 256 个字符的限制）。

为了避免这种情况，我想在批处理文件中定义变量（路径、用户数据、文件名）并在 multiprog 配置文件中使用它们。

阿姨 google 和简陋的文档没有给我提示。我研究了使用环境变量，但还没有找到设置我自己的方法。

有什么提示吗？

Answer 1

multiprog 配置文件中的命令行是 exec 的，而不是用 Bash 解析的，因此您需要显式调用 Bash shell。

例如：

$ export VAR=VALUE

我在环境中设置了一个VAR变量，值为VALUE并使用下面的conf文件来说明：

$ cat multi.conf
0   echo $VAR
1   bash -c 'echo $VAR'

任务 0 将简单地 exec 编辑，而任务 1 将首先由 Bash 解析。结果：

$ srun -n2 -l --multi-prog multi.conf
0: $VAR
1: VALUE

Taks 0 回应变量名称，而任务 1 回应变量的值。但要注意你需要额外花费10个字符。

How to declare a variable in a Slurm batch file and use it in the multiprog conf?