mac OS X 上的 c 代码编译错误

Question

我正在尝试在我的 macbook pro（yosmite 10.10.2，Xcode 6.2）上编译一个简单的 c 代码。

#include <stdio.h>
#include "htslib/sam.h"

int main(int argc, char *argv[]){

    htsFile *fp_in = NULL;

    fp_in = hts_open(argv[1],"r");

    if(NULL == fp_in){
        printf("can't open file\n");
    }

    return 0;
}

但是我有编译错误。

gcc -g -Wall -v test_bam.c -o test_bam

Undefined symbols for architecture x86_64:
  "_hts_open", referenced from:
      _main in test_bam-7d7369.o
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

我在 /usr/local/include 目录下有所有必要的头文件。我用谷歌搜索了很多，这似乎是一个简单的链接问题。我尝试使用 -L 参数进行编译，但我仍然遇到同样的问题。然后我尝试使用 -arch i386 ，但它也不起作用。我也尝试过 clang 作为类似 post 建议之一，但同样的问题。

挣扎了六个小时后，我post来到了这里。

谢谢。

Answer 1

如果你想包含 htslib/sam.h header 你必须查看 /usr/local/include 文件夹，所以添加 -I/usr/local/include 到你的编译器标志。

此外，您还必须将 c 文件的第 2 行更改为：

#include <htslib/sam.h>

Angular 大括号表示在系统目录中搜索 header 文件，而带引号的语法表示在本地路径中搜索。

假设您的 hts 库安装在 /usr/local/lib/ 中，您可以添加 -L/usr/local/lib 标志。

最后使用 libhts 库将 -lhts 标记添加到 link。

gcc -g -Wall -L/usr/local/lib -I/usr/local/lib -lhts test_bam.c -o test_bam

mac OS X 上的 c 代码编译错误

c code compilation error on mac OS X

c

macos

compiler-errors

osx-yosemite