将高斯混合模型拟合到单个特征数据的正确方法是什么?
What is the correct way to fit a gaussian mixture model to single feature data?
data
是一维数据数组。
data = [0.0, 7000.0, 0.0, 7000.0, -400.0, 0.0, 7000.0, -400.0, -7400.0, 7000.0, -400.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, 0.0, 0.0, -7000.0, 7000.0, 7000.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, 6600.0, -7400.0, -400.0, 6600.0, -400.0, -400.0, 6600.0, 6600.0, 6600.0, 7000.0, 6600.0, -7000.0, 0.0, 0.0, -7000.0, -7400.0, 6600.0, -400.0, 7000.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, 0.0, -400.0, -7000.0, -7000.0, 7000.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, 0.0, 0.0, 6600.0, 6600.0, 6600.0, -7400.0, -400.0, -2000.0, -7000.0, -400.0, -7400.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, -400.0, -7400.0, -7400.0, 0.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, -400.0, -400.0, 6600.0, 0.0, -400.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, 0.0, -400.0, 0.0, -400.0]
我想对这些数据拟合一些高斯并绘制它们。
如果我运行
import numpy as np
from sklearn import mixture
x = np.array(data)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=2, covariance_type='full')
clf.fit(x)
我收到错误
ValueError: Expected n_samples >= n_components but got n_components = 2, n_samples = 1
和
DeprecationWarning: Passing 1d arrays as data is deprecated in 0.17 and will raise ValueError in 0.19. Reshape your data either using X.reshape(-1, 1) if your data has a single feature or X.reshape(1, -1) if it contains a single sample.
好吧...我可以忍受这个。警告告诉我该怎么做。但是,如果我 运行
x = np.array(data).reshape(-1,1)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=2, covariance_type='full')
clf.fit(x)
我收到错误
ValueError: Expected the input data X have 1 features, but got 32000 features
我做错了什么?什么是正确的方法?
编辑:
我刚刚意识到我看错了错误信息。不是 fit()
正在下雨,而是 score_samples()
.
之后我正在尝试绘制高斯曲线。
x = np.linspace(-8000,8000,32000)
y = clf.score_samples(x)
plt.plot(x, y)
plt.show()
所以 x
似乎是问题所在。然而,x.reshape(-1,1)
和 x.reshape(1,-1)
都没有帮助。
如果您只有一个特征有很多样本,请尝试
your_samples_list = map(lambda x:[x], your_samples_list)
这会将其转换为列表列表
[a,b,c] -> [[a],[b],[c]]
我自己发现了错误。正如我在编辑中所说,不是 fit()
引发了错误,而是 score_samples()
.
这两个函数都需要一个多维数组。
工作代码:
data = np.array(data).reshape(-1,1)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=1, covariance_type='full')
clf.fit(data)
x = np.array(np.linspace(-8000,8000,32000)).reshape(-1,1)
y = clf.score_samples(x)
plt.plot(x, y)
plt.show()
data
是一维数据数组。
data = [0.0, 7000.0, 0.0, 7000.0, -400.0, 0.0, 7000.0, -400.0, -7400.0, 7000.0, -400.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, 0.0, 0.0, -7000.0, 7000.0, 7000.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, 6600.0, -7400.0, -400.0, 6600.0, -400.0, -400.0, 6600.0, 6600.0, 6600.0, 7000.0, 6600.0, -7000.0, 0.0, 0.0, -7000.0, -7400.0, 6600.0, -400.0, 7000.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, 0.0, -400.0, -7000.0, -7000.0, 7000.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, 0.0, 0.0, 6600.0, 6600.0, 6600.0, -7400.0, -400.0, -2000.0, -7000.0, -400.0, -7400.0, 7000.0, 0.0, -7000.0, -7000.0, 0.0, -400.0, -7400.0, -7400.0, 0.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, -400.0, -400.0, 6600.0, 0.0, -400.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, 0.0, 0.0, -400.0, -400.0, 0.0, -400.0, 0.0, -400.0]
我想对这些数据拟合一些高斯并绘制它们。
如果我运行
import numpy as np
from sklearn import mixture
x = np.array(data)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=2, covariance_type='full')
clf.fit(x)
我收到错误
ValueError: Expected n_samples >= n_components but got n_components = 2, n_samples = 1
和
DeprecationWarning: Passing 1d arrays as data is deprecated in 0.17 and will raise ValueError in 0.19. Reshape your data either using X.reshape(-1, 1) if your data has a single feature or X.reshape(1, -1) if it contains a single sample.
好吧...我可以忍受这个。警告告诉我该怎么做。但是,如果我 运行
x = np.array(data).reshape(-1,1)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=2, covariance_type='full')
clf.fit(x)
我收到错误
ValueError: Expected the input data X have 1 features, but got 32000 features
我做错了什么?什么是正确的方法?
编辑:
我刚刚意识到我看错了错误信息。不是 fit()
正在下雨,而是 score_samples()
.
之后我正在尝试绘制高斯曲线。
x = np.linspace(-8000,8000,32000)
y = clf.score_samples(x)
plt.plot(x, y)
plt.show()
所以 x
似乎是问题所在。然而,x.reshape(-1,1)
和 x.reshape(1,-1)
都没有帮助。
如果您只有一个特征有很多样本,请尝试
your_samples_list = map(lambda x:[x], your_samples_list)
这会将其转换为列表列表
[a,b,c] -> [[a],[b],[c]]
我自己发现了错误。正如我在编辑中所说,不是 fit()
引发了错误,而是 score_samples()
.
这两个函数都需要一个多维数组。
工作代码:
data = np.array(data).reshape(-1,1)
clf = mixture.GaussianMixture(n_components=1, covariance_type='full')
clf.fit(data)
x = np.array(np.linspace(-8000,8000,32000)).reshape(-1,1)
y = clf.score_samples(x)
plt.plot(x, y)
plt.show()