转换矩阵,以便可以在 R 中用热图绘制它
Transform a matrix so that it can be plotted with heatmap in R
我有一个矩阵,我想在热图中使用 ggplot 进行可视化,例如 R 中的 geom_tile。当前数据的格式为
I II
A 1 2
B 3 4
但是,要使用 ggplot,我需要将此矩阵转换为格式如下的数据框:
Var1 Var2 Value
A I 1
A II 2
B I 3
B II 4
如何将矩阵转换为这种格式以便我可以使用 ggplot?我不想要像 gplot 这样的可视化包,因为它看起来慢了很多。谢谢
你能用代码展示一下你是如何创建数据的吗?我尝试自己编写代码,融化效果很好。
a = matrix(c(1, 3, 2, 4), 2, dimnames = list(c('A', 'B'), c('I', 'II')))
melt(a)
这是我得到的:
Var1 Var2 value
1 A I 1
2 B I 3
3 A II 2
4 B II 4
我有一个矩阵,我想在热图中使用 ggplot 进行可视化,例如 R 中的 geom_tile。当前数据的格式为
I II
A 1 2
B 3 4
但是,要使用 ggplot,我需要将此矩阵转换为格式如下的数据框:
Var1 Var2 Value
A I 1
A II 2
B I 3
B II 4
如何将矩阵转换为这种格式以便我可以使用 ggplot?我不想要像 gplot 这样的可视化包,因为它看起来慢了很多。谢谢
你能用代码展示一下你是如何创建数据的吗?我尝试自己编写代码,融化效果很好。
a = matrix(c(1, 3, 2, 4), 2, dimnames = list(c('A', 'B'), c('I', 'II')))
melt(a)
这是我得到的:
Var1 Var2 value
1 A I 1
2 B I 3
3 A II 2
4 B II 4