如何在 R googleVis sankey 图表中更改节点和 link 颜色

Question

如何在 R googleVis sankey 图表中更改节点和 link 颜色？并且 link 与其原始节点具有相同的颜色？

library(googleVis)
datSK <- data.frame(From=c(rep("A",3), rep("B", 3)),
                To=c(rep(c("X", "Y", "Z"),2)),
                Weight=c(5,7,6,2,9,4))

Sankey <- gvisSankey(datSK, from="From", to="To", weight="Weight",
                 options=list(
                   sankey="{link: {color: { fill: '#d799ae' } },
                        node: { color: { fill: '#a61d4c' },
                        label: { color: '#871b47' } }}"))
plot(Sankey)

Answer 1

一旦您必须为来自 2 个起源节点的链接着色，您就需要 2 种链接颜色。另外你总共有 5 个节点，所以你需要 5 种颜色。

让我们以 JSON 格式创建 2 个数组，并为节点和链接设置颜色

colors_link <- c('green', 'blue')
colors_link_array <- paste0("[", paste0("'", colors_link,"'", collapse = ','), "]")

colors_node <- c('yellow', 'lightblue', 'red', 'black', 'brown')
colors_node_array <- paste0("[", paste0("'", colors_node,"'", collapse = ','), "]")

接下来，将该数组插入选项：

opts <- paste0("{
        link: { colorMode: 'source',
                colors: ", colors_link_array ," },
        node: { colors: ", colors_node_array ," }
      }" )

最后绘制图形：

plot( gvisSankey(datSK, from="From", to="To", weight="Weight",
                     options=list(
                       sankey=opts)))

请注意，在选项中，colorMode 设置为 'source'，这意味着您想要为来自原始节点的链接着色。或者，将 'target' 设置为目标节点的颜色链接

编辑：添加多级 sankeys 的描述

找到如何为多级 sankeys 分配颜色有点棘手。

我们需要创建其他日期框：

datSK <- data.frame(From=c(rep("A",3), rep("B", 3), rep(c("X", "Y", "Z"), 2 )),
                To=c(rep(c("X", "Y", "Z"),2), rep("M", 3), rep("N", 3)),
                Weight=c(5,7,6,2,9,4,3,4,5,6, 4,8))

这里我们只需要改变颜色数组。建造地块的命令是一样的假设我们想要这些颜色用于节点和链接：

colors_link <- c('green', 'blue', 'yellow', 'brown', 'red')
colors_link_array <- paste0("[", paste0("'", colors_link,"'", collapse = ','), "]")

colors_node <- c('yellow', 'lightblue', 'red', 'black', 'brown', 'green', 'brown')
colors_node_array <- paste0("[", paste0("'", colors_node,"'", collapse = ','), "]")

结果将是：

最棘手的部分是了解如何分配这些颜色：

链接按照它们在数据集中出现的顺序分配 (row_wise)

节点的颜色是按照构建的顺序分配的。
- 从 A 到 X、Y、Z - 绿色
- 从 X 到 M，N - 蓝色
- 从 Y 到 M，N - 黄色
- 从 Z 到 M，N - 棕色
- 从 B 到 X、Y、Z - 红色

关于如何格式化桑基图的更多详细信息：https://developers.google.com/chart/interactive/docs/gallery/sankey

Answer 2

我已经编写了 github 一段代码来执行此操作。

#TOPLOTS[,1] = from ; TOPLOTS[,1] = to
names_pahtwayorder<-unlist(data.frame(t(TOPLOTs[,1:2])))
names_pahtwayorder<-names_pahtwayorder[!duplicated(names_pahtwayorder)]
names(names_pahtwayorder)<-NULL; names_pahtwayorder

https://github.com/SkanderMulder/ExtractIPA/blob/master/functionSankey.r

Answer 3

我知道这是旧的，但以防万一其他人被困在这个问题上 - 我想出了如何做出正确的顺序并生成一串颜色节点，以便您可以为某些标签自定义颜色。向@vadym-b 大喊以获取数据并解释订单。看看：

#convert to list combined of source and target for color order
# edges is a dataframe from @vadym-b's answer above
edges <- data.frame(From=c(rep("A",3), rep("B", 3), rep(c("X", "Y", "Z"), 2 )),
                    To=c(rep(c("X", "Y", "Z"),2), rep("M", 3), rep("N", 3)),
                    Weight=c(5,7,6,2,9,4,3,4,5,6, 4,8))

#we have to make the order right - you need a list
# that is a combination of From, To, From, To, From, To
nc.df <- c()
for (i in 1:nrow(edges)) {
  nc.df <- c(nc.df, as.character(edges$From[i]), as.character(edges$To[i]))
}

#the actualy parsing - get the unique list and return
# colors based on what the source or target value is
nodeColor <- sapply(unique(nc.df), function(r) {
  if (grepl('A',r)) return('red')
  if (grepl('B',r)) return('red')
  if (grepl('Z',r)) return('green')
  if (grepl('X',r)) return('green')
  if (grepl('Y',r)) return('purple')
  if (grepl('M',r)) return('blue')
  if (grepl('N',r)) return('blue')
  #return a default color if you like
  return('black')
})

#make a sankey
library(googleVis)

# put the color list in a collapsed string
sankey <- gvisSankey(
  edges, 
  chartid = 'Sankey', 
  from="From", 
  to="To", 
  weight="Weight", 
  options=list(
    sankey = paste0("{
      iterations: 0,
      link: {
        colorMode: 'gradient'
      },
      node: {
        colors: ['",paste(nodeColor,collapse="','"),"']
      }
    }")
  )
)

plot(sankey)

如何在 R googleVis sankey 图表中更改节点和 link 颜色

How to change node and link colors in R googleVis sankey chart

r

googlevis

sankey-diagram