Snakemake：包装器命令日志记录
Snakemake: Wrapper command logging
我不知道如何记录包装器执行的命令。 "snakemake -p" 和 "snakemake -D" 都没有向我显示 运行.
的实际命令
记录通过包装器创建的命令的最佳方法是什么？
干杯，
塞布
因此，目前，-p 确实没有传播到脚本或包装器。但是，我刚刚在代码中更改了它，即将发布的 4.0 版将通过 snakemake -p 为您提供所需的内容。
请注意，包装程序通常不仅仅执行单个 shell 命令。您可以在包装器描述的相应页面上找到包装器的完整源代码。例如，bwa mem 见此处：https://snakemake-wrappers.readthedocs.io/en/stable/wrappers/bwa/mem.html#code
我不知道如何记录包装器执行的命令。 "snakemake -p" 和 "snakemake -D" 都没有向我显示 运行.
的实际命令记录通过包装器创建的命令的最佳方法是什么？
干杯， 塞布
因此，目前，-p 确实没有传播到脚本或包装器。但是，我刚刚在代码中更改了它，即将发布的 4.0 版将通过 snakemake -p 为您提供所需的内容。
请注意，包装程序通常不仅仅执行单个 shell 命令。您可以在包装器描述的相应页面上找到包装器的完整源代码。例如，bwa mem 见此处：https://snakemake-wrappers.readthedocs.io/en/stable/wrappers/bwa/mem.html#code