OpenMPI 为特定节点指定可执行文件
OpenMPI specify executable for specific nodes
我有一个异构计算集群，我想 运行 使用 OpenMPI 并行计算任务。由于并非集群中的所有节点都可以 运行 相同的可执行文件（由于是异构的）我希望一些节点编译他们自己的程序版本并让 Open MPI 在这些节点上调用该可执行文件。我的第一个问题是 OpenMPI 是否支持这种跨异构架构的计算。
如果是这样，我的第二个问题是如何在哪些节点上指定哪些可执行文件运行。例如，假设 node0、node1 和 node2 可以 运行 执行 prog1 和 node3、node4 和 node5 可以 运行 执行 prog2，其中 prog1 和 prog2 是同一个程序，但使用 mpicc 或 mpic++ 针对不同的体系结构编译包装器编译器。
如果我想 运行 这个程序在所有节点上并行执行，我会执行以下操作：
mpirun -n 3 --hosts node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --hosts node3,node4,node5 prog2
如果没有，我该怎么做才能达到这种效果？ This post 表示 OpenMPI 支持异构集群计算，但我必须使用 --enable-heterogeneous 标志构建 OpenMPI。我不确定如何执行此操作，因为我的集群是 运行ning ArchLinux 并且我使用 pacman.
安装了 OpenMPI
注意有错别字（--host不需要结尾s），所以你的命令应该是
mpirun -n 3 --host node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --host node3,node4,node5 prog2
--enable-heterogeneous 是必需的，因此 Open MPI 在异构系统上可以是 运行（例如在 Intel x86_64（小端）和 sparcv9（大端）节点之间）。如果 OpenMPI（与 ArchLinux 一起提供）没有配置这个标志，那么你应该重建这个包。另一种选择是重建 Open MPI 并将其安装到备用目录中。
最后但同样重要的是，异构支持经过（非常）简单的测试，我强烈建议您使用最新的 Open MPI 3.0 系列。
我有一个异构计算集群，我想 运行 使用 OpenMPI 并行计算任务。由于并非集群中的所有节点都可以 运行 相同的可执行文件（由于是异构的）我希望一些节点编译他们自己的程序版本并让 Open MPI 在这些节点上调用该可执行文件。我的第一个问题是 OpenMPI 是否支持这种跨异构架构的计算。
如果是这样，我的第二个问题是如何在哪些节点上指定哪些可执行文件运行。例如，假设 node0、node1 和 node2 可以 运行 执行 prog1 和 node3、node4 和 node5 可以 运行 执行 prog2，其中 prog1 和 prog2 是同一个程序，但使用 mpicc 或 mpic++ 针对不同的体系结构编译包装器编译器。
如果我想 运行 这个程序在所有节点上并行执行，我会执行以下操作：
mpirun -n 3 --hosts node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --hosts node3,node4,node5 prog2
如果没有，我该怎么做才能达到这种效果？ This post 表示 OpenMPI 支持异构集群计算，但我必须使用 --enable-heterogeneous 标志构建 OpenMPI。我不确定如何执行此操作，因为我的集群是 运行ning ArchLinux 并且我使用 pacman.
注意有错别字（--host不需要结尾s），所以你的命令应该是
mpirun -n 3 --host node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --host node3,node4,node5 prog2
--enable-heterogeneous 是必需的，因此 Open MPI 在异构系统上可以是 运行（例如在 Intel x86_64（小端）和 sparcv9（大端）节点之间）。如果 OpenMPI（与 ArchLinux 一起提供）没有配置这个标志，那么你应该重建这个包。另一种选择是重建 Open MPI 并将其安装到备用目录中。
最后但同样重要的是，异构支持经过（非常）简单的测试，我强烈建议您使用最新的 Open MPI 3.0 系列。