扩展中的致命错误：PyThreadState_Get：在 Mac 上将 SWIG 与 Anaconda3 结合使用时没有当前线程

Question

我只在 anaconda3 和 Mac 上遇到这个错误。有人对如何解决这个问题有什么建议吗？

这是 test.i 文件。

# test.i
%module test

%{
int hello();
%}

这是 test.c 文件。

//test.c
#include <stdio.h>

int hello() {

    printf("Hello\n");
    return 0;

}

这是创建扩展的编译步骤。

$ swig -python test.i
$ cc -c $(python3-config  --cflags) test.c test_wrap.c
$ cc -bundle -L/Users/$USER/miniconda3/lib/python3.6/config-3.6m-darwin -lpython3.6m -ldl test.o test_wrap.o -o _test.so

$ python test.py
Fatal Python error: PyThreadState_Get: no current thread

[1]    97445 abort      python test.py

同样，任何其他操作系统都没有错误。他们相应的步骤工作。它适用于 Homebrew Python2 和 Homebrew Python3。它也适用于 Anaconda2。但它不适用于 Anaconda3 或 Anaconda3 环境。

请参阅下面的最小工作示例。

https://github.com/kdheepak/mwe-swig-python3-anaconda

Answer 1

问题很可能是您正尝试 link 针对 python3.6 库，而 python 可执行文件已经具有 python 库 link编入。

尝试做与 setup.py 相同的事情（这对您的 github 示例很有效）：

#!/usr/bin/env python
from distutils.core import setup, Extension
test_module = Extension('_test', sources=['test_wrap.c', 'test.c'],)
setup (name = 'test', version = '0.1', ext_modules = [test_module], py_modules = ["test"],)

您将看到这会创建一个 link 命令，该命令使用 -undefined dynamic_lookup 而没有明确地 linking 针对 python3.6m 或 ld 库。

Answer 2

python3-config --cflags 不应该不在为 Python 创建扩展模块时使用，也不应该总是 link 到 Python 图书馆。相反，您应该查询 Python 本身（特别是 distutils sysconfig 模块）以获取适当的值。

应该通过以下方式查询编译器标志： python -c "from distutils import sysconfig; print(sysconfig.get_config_vars('CFLAGS'))"

应通过以下方式查询 linker 标志： python -c "from distutils import sysconfig; print(sysconfig.get_config_var('BLDSHARED').split(' ', 1)[1])"

扩展中的致命错误：PyThreadState_Get：在 Mac 上将 SWIG 与 Anaconda3 结合使用时没有当前线程

Fatal error in extension: PyThreadState_Get: no current thread when using SWIG with Anaconda3 on a Mac

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