snakemake 同时使用 --keep-going 和 --stats
snakemake use both --keep-going and --stats
--keep-going 标志告诉 snakemake 在作业失败时继续独立作业。
--stats /path_to_the_runtime_statistics_file 选项在管道末端生成所有规则的运行时统计信息。
但是，如果作业失败，则管道根本不会生成运行时统计文件。
IE。如果您有 100 个作业并且只有一个失败，则不会生成有关 99 个成功作业的运行时统计信息。
应该如何获得作业成功的运行时统计信息？
提前致谢。
如果您看到蛇，请制作 API 关于如何调用 --stats 的文档 execute function implementation. You will get to know that, the implementation calls snakemake.stats module implemtation
在 if success: 的条件下！
所以，对你的问题的直接回答是不，你做不到！
两种前进方式：
- 快速简单的解决方案使用他们的统计实现，并根据您的需要编写您想要执行的操作 taking/calling 特定功能！ :)
from snakemake import stats
and do whatever you want .....
- 如果不能，请在 snakemake github 上创建一个问题，他们的开发人员将根据优先级将此功能添加到较新版本的 snakemake 中！过程很慢。
--keep-going 标志告诉 snakemake 在作业失败时继续独立作业。
--stats /path_to_the_runtime_statistics_file 选项在管道末端生成所有规则的运行时统计信息。
但是，如果作业失败，则管道根本不会生成运行时统计文件。
IE。如果您有 100 个作业并且只有一个失败，则不会生成有关 99 个成功作业的运行时统计信息。
应该如何获得作业成功的运行时统计信息？
提前致谢。
如果您看到蛇，请制作 API 关于如何调用 --stats 的文档 execute function implementation. You will get to know that, the implementation calls snakemake.stats module implemtation
在 if success: 的条件下！
所以，对你的问题的直接回答是不，你做不到！
两种前进方式：
- 快速简单的解决方案使用他们的统计实现，并根据您的需要编写您想要执行的操作 taking/calling 特定功能！ :)
from snakemake import stats
and do whatever you want .....
- 如果不能，请在 snakemake github 上创建一个问题，他们的开发人员将根据优先级将此功能添加到较新版本的 snakemake 中！过程很慢。