r如何减去不同长度矩阵的元素

r how to subtract elements of different length matrices

我有两个具有相同行数(22 行)和不同列数的数据框。

sim_10(22 行,15 列):

2    0.577967    0.023869   0.021571    0.481754    0.61584     0    0   0  0  0     0.024057    0.014209   1    0.085784


8   0.0775       0.274113   2.7e-05     0.01215     0.009345    0    0  0   0   0   0.004092     0.00784    0     0

我怎样才能简单地做到这一点.. ...

nm_10(22 行,8 列)

11  0.926554    0.256966    0.859375    0   0.191011    0   0           0
2   0.858757    0.256966    0.21875     0   0.662921    0   0.845506    0.090909
 ..

两个数据框的第一列相同,只是顺序不同(案例名称)。我需要在 nm_10 和 sm_10 中找到匹配的行名称,并将该行中 sm_10 的每个元素减去 nm_10 中的每个元素。示例:

对于 '2' sm_nm_10:

  2 (0.577967-0.858757=-0.28079)    (0.577967-0.256966=)    (0.577967-0.21875)  ...(0.577967-0.090909=..)

    (0.023869-0.858757=)    (0.023869-0.256966=)    (0.023869-0.21875)  ...(0.023869-0.090909=..)

 ....

(0.085784-0.858757=)    (0.085784-0.256966=)    (0.085784-0.21875)  ...(0.085784-0.090909=..)

以及所有数据。 检查每一行的第一列,找到匹配的行并进行操作。 有什么简单的方法吗?我查看了 sweep,apply 但不知道如何使用它们。我不断收到有关长度等的错误。我决定保持简单,这就是我所拥有的:

s = numeric()

for (i in 1:nrow(sm_10))
{
for (jj in 1:nrow(nm_10))
{ 
 for (j in 2:ncol(nm_10))
 {
  for (ii in 2:ncol(sm_10))
 {
 sm_10[i,]%in% nm_10[jj,]

s <- sm_10[,ii]-nm_10[,j]
  }}}}

这里有什么问题?谁能更好地解释和建议?

更新:

我需要的最终结果是所有第 22 行的元素减法。那是 22 行,有 (14*7) 列..

我们可以通过索引子集数据集 ("nm_10") 的行名和列名来对较大的数据集 ("sim_10") 进行子集化,然后减去子集数据 (在相应的 row/column 位置 "nm_10") 来自 "nm_10".

sim_10[rownames(nm_10),colnames(nm_10)] - nm_10

数据

set.seed(24)
sim_10 <- as.data.frame(matrix(sample(1:20, 22*15, replace=TRUE), ncol=15))
set.seed(42)
nm_10 <- as.data.frame(matrix(sample(1:40, 22*8, replace=TRUE), ncol=8))
set.seed(32)
colnames(nm_10) <- sample(colnames(sim_10), 8, replace=FALSE)
rownames(nm_10) <- sample(rownames(sim_10), 22, replace=FALSE)

我认为这里最好的解决方案是通过足够的乘数复制 LHS,使其具有所需的输出宽度,然后简单地从中减去 RHS。这自然是一个矢量化减法,并将 RHS 循环足够次数以完全覆盖加宽的 LHS。我们必须注意确保元素配对正确,这需要两件事:(1) 重新排序 RHS 的行,使键值与 LHS 对齐,以及 (2) 使用 [= 复制 LHS rep() 的 12=] 参数,而不是 times 参数:

df1 <- as.data.frame(cbind(sample(1:22),matrix(1:(22*14),22)));
df2 <- as.data.frame(cbind(sample(1:22),matrix(1:(22*7),22)));
df1;
##    V1 V2 V3 V4 V5  V6  V7  V8  V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15
## 1  22  1 23 45 67  89 111 133 155 177 199 221 243 265 287
## 2  20  2 24 46 68  90 112 134 156 178 200 222 244 266 288
## 3  13  3 25 47 69  91 113 135 157 179 201 223 245 267 289
## 4  12  4 26 48 70  92 114 136 158 180 202 224 246 268 290
## 5  16  5 27 49 71  93 115 137 159 181 203 225 247 269 291
## 6   7  6 28 50 72  94 116 138 160 182 204 226 248 270 292
## 7   1  7 29 51 73  95 117 139 161 183 205 227 249 271 293
## 8   2  8 30 52 74  96 118 140 162 184 206 228 250 272 294
## 9   9  9 31 53 75  97 119 141 163 185 207 229 251 273 295
## 10 14 10 32 54 76  98 120 142 164 186 208 230 252 274 296
## 11  4 11 33 55 77  99 121 143 165 187 209 231 253 275 297
## 12 21 12 34 56 78 100 122 144 166 188 210 232 254 276 298
## 13 15 13 35 57 79 101 123 145 167 189 211 233 255 277 299
## 14 10 14 36 58 80 102 124 146 168 190 212 234 256 278 300
## 15  8 15 37 59 81 103 125 147 169 191 213 235 257 279 301
## 16  6 16 38 60 82 104 126 148 170 192 214 236 258 280 302
## 17 19 17 39 61 83 105 127 149 171 193 215 237 259 281 303
## 18  3 18 40 62 84 106 128 150 172 194 216 238 260 282 304
## 19  5 19 41 63 85 107 129 151 173 195 217 239 261 283 305
## 20 18 20 42 64 86 108 130 152 174 196 218 240 262 284 306
## 21 17 21 43 65 87 109 131 153 175 197 219 241 263 285 307
## 22 11 22 44 66 88 110 132 154 176 198 220 242 264 286 308
df2;
##    V1 V2 V3 V4 V5  V6  V7  V8
## 1   6  1 23 45 67  89 111 133
## 2  17  2 24 46 68  90 112 134
## 3  12  3 25 47 69  91 113 135
## 4  20  4 26 48 70  92 114 136
## 5  13  5 27 49 71  93 115 137
## 6  10  6 28 50 72  94 116 138
## 7  16  7 29 51 73  95 117 139
## 8  15  8 30 52 74  96 118 140
## 9  21  9 31 53 75  97 119 141
## 10 22 10 32 54 76  98 120 142
## 11  1 11 33 55 77  99 121 143
## 12 18 12 34 56 78 100 122 144
## 13  9 13 35 57 79 101 123 145
## 14  4 14 36 58 80 102 124 146
## 15 11 15 37 59 81 103 125 147
## 16 19 16 38 60 82 104 126 148
## 17  8 17 39 61 83 105 127 149
## 18  5 18 40 62 84 106 128 150
## 19  3 19 41 63 85 107 129 151
## 20  7 20 42 64 86 108 130 152
## 21  2 21 43 65 87 109 131 153
## 22 14 22 44 66 88 110 132 154
cbind(df1[,1],as.data.frame(rep(df1[,-1],each=ncol(df2)-1))-as.matrix(df2[match(df1[,1],df2[,1]),-1]));
##    df1[, 1]  V2 V2.1 V2.2 V2.3 V2.4 V2.5 V2.6 V3 V3.1 V3.2 V3.3 V3.4 V3.5 V3.6 V4 V4.1 V4.2 V4.3 V4.4 V4.5 V4.6 V5 V5.1 V5.2 V5.3 V5.4 V5.5 V5.6  V6 V6.1 V6.2 V6.3 V6.4 V6.5 V6.6  V7 V7.1 V7.2 V7.3 V7.4 V7.5 V7.6  V8 V8.1 V8.2 V8.3 V8.4 V8.5 V8.6  V9 V9.1 V9.2 V9.3 V9.4 V9.5 V9.6 V10 V10.1 V10.2 V10.3 V10.4 V10.5 V10.6 V11 V11.1 V11.2 V11.3 V11.4 V11.5 V11.6 V12 V12.1 V12.2 V12.3 V12.4 V12.5 V12.6 V13 V13.1 V13.2 V13.3 V13.4 V13.5 V13.6 V14 V14.1 V14.2 V14.3 V14.4 V14.5 V14.6 V15 V15.1 V15.2 V15.3 V15.4 V15.5 V15.6
## 1        22  -9  -31  -53  -75  -97 -119 -141 13   -9  -31  -53  -75  -97 -119 35   13   -9  -31  -53  -75  -97 57   35   13   -9  -31  -53  -75  79   57   35   13   -9  -31  -53 101   79   57   35   13   -9  -31 123  101   79   57   35   13   -9 145  123  101   79   57   35   13 167   145   123   101    79    57    35 189   167   145   123   101    79    57 211   189   167   145   123   101    79 233   211   189   167   145   123   101 255   233   211   189   167   145   123 277   255   233   211   189   167   145
## 2        20  -2  -24  -46  -68  -90 -112 -134 20   -2  -24  -46  -68  -90 -112 42   20   -2  -24  -46  -68  -90 64   42   20   -2  -24  -46  -68  86   64   42   20   -2  -24  -46 108   86   64   42   20   -2  -24 130  108   86   64   42   20   -2 152  130  108   86   64   42   20 174   152   130   108    86    64    42 196   174   152   130   108    86    64 218   196   174   152   130   108    86 240   218   196   174   152   130   108 262   240   218   196   174   152   130 284   262   240   218   196   174   152
## 3        13  -2  -24  -46  -68  -90 -112 -134 20   -2  -24  -46  -68  -90 -112 42   20   -2  -24  -46  -68  -90 64   42   20   -2  -24  -46  -68  86   64   42   20   -2  -24  -46 108   86   64   42   20   -2  -24 130  108   86   64   42   20   -2 152  130  108   86   64   42   20 174   152   130   108    86    64    42 196   174   152   130   108    86    64 218   196   174   152   130   108    86 240   218   196   174   152   130   108 262   240   218   196   174   152   130 284   262   240   218   196   174   152
## 4        12   1  -21  -43  -65  -87 -109 -131 23    1  -21  -43  -65  -87 -109 45   23    1  -21  -43  -65  -87 67   45   23    1  -21  -43  -65  89   67   45   23    1  -21  -43 111   89   67   45   23    1  -21 133  111   89   67   45   23    1 155  133  111   89   67   45   23 177   155   133   111    89    67    45 199   177   155   133   111    89    67 221   199   177   155   133   111    89 243   221   199   177   155   133   111 265   243   221   199   177   155   133 287   265   243   221   199   177   155
## 5        16  -2  -24  -46  -68  -90 -112 -134 20   -2  -24  -46  -68  -90 -112 42   20   -2  -24  -46  -68  -90 64   42   20   -2  -24  -46  -68  86   64   42   20   -2  -24  -46 108   86   64   42   20   -2  -24 130  108   86   64   42   20   -2 152  130  108   86   64   42   20 174   152   130   108    86    64    42 196   174   152   130   108    86    64 218   196   174   152   130   108    86 240   218   196   174   152   130   108 262   240   218   196   174   152   130 284   262   240   218   196   174   152
## 6         7 -14  -36  -58  -80 -102 -124 -146  8  -14  -36  -58  -80 -102 -124 30    8  -14  -36  -58  -80 -102 52   30    8  -14  -36  -58  -80  74   52   30    8  -14  -36  -58  96   74   52   30    8  -14  -36 118   96   74   52   30    8  -14 140  118   96   74   52   30    8 162   140   118    96    74    52    30 184   162   140   118    96    74    52 206   184   162   140   118    96    74 228   206   184   162   140   118    96 250   228   206   184   162   140   118 272   250   228   206   184   162   140
## 7         1  -4  -26  -48  -70  -92 -114 -136 18   -4  -26  -48  -70  -92 -114 40   18   -4  -26  -48  -70  -92 62   40   18   -4  -26  -48  -70  84   62   40   18   -4  -26  -48 106   84   62   40   18   -4  -26 128  106   84   62   40   18   -4 150  128  106   84   62   40   18 172   150   128   106    84    62    40 194   172   150   128   106    84    62 216   194   172   150   128   106    84 238   216   194   172   150   128   106 260   238   216   194   172   150   128 282   260   238   216   194   172   150
## 8         2 -13  -35  -57  -79 -101 -123 -145  9  -13  -35  -57  -79 -101 -123 31    9  -13  -35  -57  -79 -101 53   31    9  -13  -35  -57  -79  75   53   31    9  -13  -35  -57  97   75   53   31    9  -13  -35 119   97   75   53   31    9  -13 141  119   97   75   53   31    9 163   141   119    97    75    53    31 185   163   141   119    97    75    53 207   185   163   141   119    97    75 229   207   185   163   141   119    97 251   229   207   185   163   141   119 273   251   229   207   185   163   141
## 9         9  -4  -26  -48  -70  -92 -114 -136 18   -4  -26  -48  -70  -92 -114 40   18   -4  -26  -48  -70  -92 62   40   18   -4  -26  -48  -70  84   62   40   18   -4  -26  -48 106   84   62   40   18   -4  -26 128  106   84   62   40   18   -4 150  128  106   84   62   40   18 172   150   128   106    84    62    40 194   172   150   128   106    84    62 216   194   172   150   128   106    84 238   216   194   172   150   128   106 260   238   216   194   172   150   128 282   260   238   216   194   172   150
## 10       14 -12  -34  -56  -78 -100 -122 -144 10  -12  -34  -56  -78 -100 -122 32   10  -12  -34  -56  -78 -100 54   32   10  -12  -34  -56  -78  76   54   32   10  -12  -34  -56  98   76   54   32   10  -12  -34 120   98   76   54   32   10  -12 142  120   98   76   54   32   10 164   142   120    98    76    54    32 186   164   142   120    98    76    54 208   186   164   142   120    98    76 230   208   186   164   142   120    98 252   230   208   186   164   142   120 274   252   230   208   186   164   142
## 11        4  -3  -25  -47  -69  -91 -113 -135 19   -3  -25  -47  -69  -91 -113 41   19   -3  -25  -47  -69  -91 63   41   19   -3  -25  -47  -69  85   63   41   19   -3  -25  -47 107   85   63   41   19   -3  -25 129  107   85   63   41   19   -3 151  129  107   85   63   41   19 173   151   129   107    85    63    41 195   173   151   129   107    85    63 217   195   173   151   129   107    85 239   217   195   173   151   129   107 261   239   217   195   173   151   129 283   261   239   217   195   173   151
## 12       21   3  -19  -41  -63  -85 -107 -129 25    3  -19  -41  -63  -85 -107 47   25    3  -19  -41  -63  -85 69   47   25    3  -19  -41  -63  91   69   47   25    3  -19  -41 113   91   69   47   25    3  -19 135  113   91   69   47   25    3 157  135  113   91   69   47   25 179   157   135   113    91    69    47 201   179   157   135   113    91    69 223   201   179   157   135   113    91 245   223   201   179   157   135   113 267   245   223   201   179   157   135 289   267   245   223   201   179   157
## 13       15   5  -17  -39  -61  -83 -105 -127 27    5  -17  -39  -61  -83 -105 49   27    5  -17  -39  -61  -83 71   49   27    5  -17  -39  -61  93   71   49   27    5  -17  -39 115   93   71   49   27    5  -17 137  115   93   71   49   27    5 159  137  115   93   71   49   27 181   159   137   115    93    71    49 203   181   159   137   115    93    71 225   203   181   159   137   115    93 247   225   203   181   159   137   115 269   247   225   203   181   159   137 291   269   247   225   203   181   159
## 14       10   8  -14  -36  -58  -80 -102 -124 30    8  -14  -36  -58  -80 -102 52   30    8  -14  -36  -58  -80 74   52   30    8  -14  -36  -58  96   74   52   30    8  -14  -36 118   96   74   52   30    8  -14 140  118   96   74   52   30    8 162  140  118   96   74   52   30 184   162   140   118    96    74    52 206   184   162   140   118    96    74 228   206   184   162   140   118    96 250   228   206   184   162   140   118 272   250   228   206   184   162   140 294   272   250   228   206   184   162
## 15        8  -2  -24  -46  -68  -90 -112 -134 20   -2  -24  -46  -68  -90 -112 42   20   -2  -24  -46  -68  -90 64   42   20   -2  -24  -46  -68  86   64   42   20   -2  -24  -46 108   86   64   42   20   -2  -24 130  108   86   64   42   20   -2 152  130  108   86   64   42   20 174   152   130   108    86    64    42 196   174   152   130   108    86    64 218   196   174   152   130   108    86 240   218   196   174   152   130   108 262   240   218   196   174   152   130 284   262   240   218   196   174   152
## 16        6  15   -7  -29  -51  -73  -95 -117 37   15   -7  -29  -51  -73  -95 59   37   15   -7  -29  -51  -73 81   59   37   15   -7  -29  -51 103   81   59   37   15   -7  -29 125  103   81   59   37   15   -7 147  125  103   81   59   37   15 169  147  125  103   81   59   37 191   169   147   125   103    81    59 213   191   169   147   125   103    81 235   213   191   169   147   125   103 257   235   213   191   169   147   125 279   257   235   213   191   169   147 301   279   257   235   213   191   169
## 17       19   1  -21  -43  -65  -87 -109 -131 23    1  -21  -43  -65  -87 -109 45   23    1  -21  -43  -65  -87 67   45   23    1  -21  -43  -65  89   67   45   23    1  -21  -43 111   89   67   45   23    1  -21 133  111   89   67   45   23    1 155  133  111   89   67   45   23 177   155   133   111    89    67    45 199   177   155   133   111    89    67 221   199   177   155   133   111    89 243   221   199   177   155   133   111 265   243   221   199   177   155   133 287   265   243   221   199   177   155
## 18        3  -1  -23  -45  -67  -89 -111 -133 21   -1  -23  -45  -67  -89 -111 43   21   -1  -23  -45  -67  -89 65   43   21   -1  -23  -45  -67  87   65   43   21   -1  -23  -45 109   87   65   43   21   -1  -23 131  109   87   65   43   21   -1 153  131  109   87   65   43   21 175   153   131   109    87    65    43 197   175   153   131   109    87    65 219   197   175   153   131   109    87 241   219   197   175   153   131   109 263   241   219   197   175   153   131 285   263   241   219   197   175   153
## 19        5   1  -21  -43  -65  -87 -109 -131 23    1  -21  -43  -65  -87 -109 45   23    1  -21  -43  -65  -87 67   45   23    1  -21  -43  -65  89   67   45   23    1  -21  -43 111   89   67   45   23    1  -21 133  111   89   67   45   23    1 155  133  111   89   67   45   23 177   155   133   111    89    67    45 199   177   155   133   111    89    67 221   199   177   155   133   111    89 243   221   199   177   155   133   111 265   243   221   199   177   155   133 287   265   243   221   199   177   155
## 20       18   8  -14  -36  -58  -80 -102 -124 30    8  -14  -36  -58  -80 -102 52   30    8  -14  -36  -58  -80 74   52   30    8  -14  -36  -58  96   74   52   30    8  -14  -36 118   96   74   52   30    8  -14 140  118   96   74   52   30    8 162  140  118   96   74   52   30 184   162   140   118    96    74    52 206   184   162   140   118    96    74 228   206   184   162   140   118    96 250   228   206   184   162   140   118 272   250   228   206   184   162   140 294   272   250   228   206   184   162
## 21       17  19   -3  -25  -47  -69  -91 -113 41   19   -3  -25  -47  -69  -91 63   41   19   -3  -25  -47  -69 85   63   41   19   -3  -25  -47 107   85   63   41   19   -3  -25 129  107   85   63   41   19   -3 151  129  107   85   63   41   19 173  151  129  107   85   63   41 195   173   151   129   107    85    63 217   195   173   151   129   107    85 239   217   195   173   151   129   107 261   239   217   195   173   151   129 283   261   239   217   195   173   151 305   283   261   239   217   195   173
## 22       11   7  -15  -37  -59  -81 -103 -125 29    7  -15  -37  -59  -81 -103 51   29    7  -15  -37  -59  -81 73   51   29    7  -15  -37  -59  95   73   51   29    7  -15  -37 117   95   73   51   29    7  -15 139  117   95   73   51   29    7 161  139  117   95   73   51   29 183   161   139   117    95    73    51 205   183   161   139   117    95    73 227   205   183   161   139   117    95 249   227   205   183   161   139   117 271   249   227   205   183   161   139 293   271   249   227   205   183   161

为了便于肉眼验证的演示,这里我将在左轴上使用三行、五个数据列,在右轴上使用两个数据列:

df1 <- as.data.frame(cbind(sample(1:3),matrix(1:(3*5),3)));
df2 <- as.data.frame(cbind(sample(1:3),matrix(1:(3*2),3)));
df1;
##   V1 V2 V3 V4 V5 V6
## 1  3  1  4  7 10 13
## 2  1  2  5  8 11 14
## 3  2  3  6  9 12 15
df2;
##   V1 V2 V3
## 1  3  1  4
## 2  2  2  5
## 3  1  3  6
cbind(df1[,1],as.data.frame(rep(df1[,-1],each=ncol(df2)-1))-as.matrix(df2[match(df1[,1],df2[,1]),-1]));
##   df1[, 1] V2 V2.1 V3 V3.1 V4 V4.1 V5 V5.1 V6 V6.1
## 1        3  0   -3  3    0  6    3  9    6 12    9
## 2        1 -1   -4  2   -1  5    2  8    5 11    8
## 3        2  1   -2  4    1  7    4 10    7 13   10

备注:

  • 由于减法步骤必须排除键列,rep() 必须对 df1[,-1] 进行操作。 -1列下标排除了key列,假定为data.frame中的第一列。
  • each 的参数必须是每个被减数的减数个数,这意味着它还必须通过从 ncol(df2) 中减去一个来排除键。
  • 从技术上讲,当给定一个 data.frame 时,rep() 在基础列表上按组件方式运行。但这符合我们的目的,因为我们可以通过调用 as.data.frame() 强制返回 data.frame,就好像每个单独的元素都在其行内水平复制一样。然后我们准备好将加宽的 data.frame 作为减法的 LHS。
  • 为了重新排序 RHS 的行,我们首先需要导出正确的行顺序。这可以用 match(df1[,1],df2[,1]) 来完成。这基本上是说 "for each key value in df1 in the order they occur in df1, return the row index in which that key value can be found in df2." 生成的索引向量然后可以用于行索引 df2 以命令它与 df1 对齐。在同一个索引操作中,我们可以排除df2的键列,为循环减法做好充分准备,从而得到df2[match(df1[,1],df2[,1]),-1].
  • 不幸的是,不可能将 data.frame 彼此相减,除非它们的大小相同(否则会出现错误 ‘-’ only defined for equally-sized data frames)。因此,我必须在减去之前在 RHS 上添加一个 as.matrix() 调用。另一种可能的解决方案是复制 RHS 以匹配 LHS 的大小。
  • 键列在减法之后必须是 "restored",因此 cbind() 调用包装了减法,它在 df1 (df1[,1]) 的键列之前.
  • 我没有费心设置任何列名,因为您没有在问题中指定对它们的要求。如有必要,您可以稍后通过 names()/setNames()/colnames()/dimnames().
  • 设置它们