设置 out.width 或 out.height 时 Knitr 不显示图形

Question

我已经 post 编辑了这个问题，但它缺少 MWE，所以我决定删除旧问题并 post 一个新问题，因为旧问题必须几乎完全重写。

我正在尝试使用 knitr 将一份 .Rmd 研究报告排版为 pdf。我想包括在 ggplot.

中创建的图表

如果我包含 out.width 或 out.height 块选项，则该图不会出现在输出 pdf 文档中。

这是 MWE：

1) 数据创建：

datas <- data.frame(x = rep(1:30), y = rep(40:69))
save(datas, file = 'datas.RData')

2) 主文件 - file.Rmd:

---
author: "NN"
title: "Title"
fontsize: 14pt
geometry: margin=2cm
output: pdf_document
header-includes: |
    \usepackage{caption}
    \usepackage{bookman}
    \usepackage{multirow}
    \usepackage{array}
    \usepackage[htt]{hyphenat}
    \usepackage{booktabs}
    \usepackage{longtable}
    \usepackage[table]{xcolor}
    \usepackage{wrapfig}
    \usepackage{float}
    \usepackage{colortbl}
    \usepackage{pdflscape}
    \usepackage{tabu}
    \usepackage{threeparttable}
    \usepackage{threeparttablex}
    \usepackage[normalem]{ulem}
    \usepackage{makecell}
    \captionsetup[table]{width=\textwidth}
    \renewcommand{\tablename}{Tablica}
    \renewcommand{\figurename}{Slika}
---
```{r setup, echo = F, include = F}
library(knitr)
library(kableExtra)
# knitr setup
opts_chunk$set(prompt = T, background = '#E5E8E8', dpi = 600, fig.width = 12, dev = 'pdf')
options(digits = 3)

# packages
library(tidyverse)
library(data.table)
library(wrapr)
library(readxl)
library(magrittr)
library(psych)
library(ggpubr)

# loading the data
load('datas.RData')
```
sample text

```{r desk_stat, child = 'file_d.Rmd'}
```

3) Sub-file（包含情节的那个）- file_d.Rmd:

```{r, fig.cap = '\label{bar-znanje-visina}Some label.', cache = T, out.width = '.49\linewidth'}
ggplot(datas,
       aes(x = x)) +
    geom_bar()
```

如果我使用这些选项排版，.md 文件中的图像包含在：

<embed src="figure/unnamed-chunk-1-1.pdf" title="\label{bar-znanje-visina}Some label." alt="\label{bar-znanje-visina}Some label." width=".49\linewidth" type="application/pdf" />

输出的 pdf 如下所示：

如果我在没有 out.width 选项的情况下排版输出，.md 文件中的图像包含在：

![\label{bar-znanje-visina}Some label.](figure/unnamed-chunk-1-1.pdf)

输出的 pdf 如下所示：

我正在编写 .Rmd 文件

Rscript -e 'library(knitr); opts_knit$set(out.format = "latex"); knit("file.Rmd")'

Session 信息：

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Manjaro Linux

Matrix products: default
BLAS: /usr/local/lib64/R/lib/libRblas.so
LAPACK: /usr/local/lib64/R/lib/libRlapack.so

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.utf8        LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=hr_HR.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.utf8     
 [5] LC_MONETARY=hr_HR.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.utf8    
 [7] LC_PAPER=hr_HR.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=hr_HR.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] kableExtra_0.9.0 knitr_1.20       nvimcom_0.9-72  

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_0.12.16      rstudioapi_0.7    xml2_1.2.0        magrittr_1.5     
 [5] hms_0.4.2         rvest_0.3.2       munsell_0.4.3     viridisLite_0.3.0
 [9] colorspace_1.3-2  R6_2.2.2          rlang_0.2.0       plyr_1.8.4       
[13] stringr_1.3.0     httr_1.3.1        tools_3.4.3       htmltools_0.3.6  
[17] rprojroot_1.3-2   digest_0.6.15     tibble_1.4.2      readr_1.1.1      
[21] evaluate_0.10.1   rmarkdown_1.9     stringi_1.1.7     compiler_3.4.3   
[25] pillar_1.2.1      scales_0.5.0      backports_1.1.2   pkgconfig_2.0.1

编辑：更新

我试过排版一辉的极简.Rnwexample，效果还不错。我还尝试修改它，以便它显示来自 MWE 的图形，并且它也可以工作。我还注意到在编译 .Rmd 文件时设置 keep_tex = true 没有任何作用。未创建 tex 文件。

Answer 1

如果您总是编写 pdf，您可以尝试在代码块设置中设置 out.width = '49%'。您也可以尝试调整代码块中的 fig.width = 设置，它采用以英寸为单位的图形宽度大小。如果所有这些都不起作用，我也会 take a look 在 gridExtra 包

的 grid.arrange() 函数

另外你的问题是不可重现的。当我运行你的代码在我的 Win10 机器上时，我得到以下输出。

Answer 2

而不是使用 knitr::knit()，使用 rmarkdown::render() 更容易。你可以直接调用它

Rscript -e 'rmarkdown::render("file.Rmd")'

或间接使用 littler 包中的示例脚本

render.r file.Rmd

在命令行上。

设置 out.width 或 out.height 时 Knitr 不显示图形

Knitr not displaying graph when out.width or out.height set

r

ggplot2

knitr