将 Travis 与 R 和 rJava 结合使用
Using Travis with R and rJava
我有一个依赖于 rJava 的 R 包。我正在使用 R 对 travis
的支持
language: r
sudo: required
warnings_are_errors: true
r_github_packages:
- keboola/redshift-r-client
但失败并出现错误:
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
完整日志:https://travis-ci.org/keboola/provisioning-r-client/builds/61021633
我尝试添加:
apt_packages:
- openjdk-7-jre
或
jdk:
- oraclejdk8
不过none好像没什么效果。
解决方案 1:
language: r
sudo: required
apt_packages:
- r-cran-rjava
解决方案 2:
language: r
sudo: required
apt_packages:
- openjdk-7-jre
before_install:
- export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
- export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
- export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
- sudo R CMD javareconf
请尝试直接通过 apt-get
安装 r-cran-rjava
。
这里有许多与 r-cran-rjava
相关的问题,因此浏览一下这些问题也可能有所帮助。此软件包的 Build-Depends
当前为 default-jdk
,Depends
在 openjdk-7-jre | default-jre
上。依靠软件包应该可以帮助你。
FWIW 我仍然使用以前的 Travis 设置,因为我发现它加载速度更快。
我有一个依赖于 rJava 的 R 包。我正在使用 R 对 travis
的支持language: r
sudo: required
warnings_are_errors: true
r_github_packages:
- keboola/redshift-r-client
但失败并出现错误:
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/usr/local/lib/R/site-library/rJava/libs/rJava.so':
libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
完整日志:https://travis-ci.org/keboola/provisioning-r-client/builds/61021633
我尝试添加:
apt_packages:
- openjdk-7-jre
或
jdk:
- oraclejdk8
不过none好像没什么效果。
解决方案 1:
language: r
sudo: required
apt_packages:
- r-cran-rjava
解决方案 2:
language: r
sudo: required
apt_packages:
- openjdk-7-jre
before_install:
- export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre
- export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
- export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib/jvm/java-8-oracle/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server
- sudo R CMD javareconf
请尝试直接通过 apt-get
安装 r-cran-rjava
。
这里有许多与 r-cran-rjava
相关的问题,因此浏览一下这些问题也可能有所帮助。此软件包的 Build-Depends
当前为 default-jdk
,Depends
在 openjdk-7-jre | default-jre
上。依靠软件包应该可以帮助你。
FWIW 我仍然使用以前的 Travis 设置,因为我发现它加载速度更快。