Holoviews RGB 坐标

Question

我正在尝试将多波段 tif 文件（4 波段 - [蓝色、绿色、红色、红外线]）读入 xarray, then display as RGB using HoloViews within a Jupyter notebook. For reference, I'm loosely following the RGB png example here: http://holoviews.org/reference/elements/matplotlib/RGB.html

最终的 RGB 图像确实显示了，但是，我通过使用 np.dstack 组合 DataArrays 失去了 x/y 坐标维度。最终图像中的 x/y 坐标默认为 ~ -0.5 - +0.5.

我不知道如何在整个过程中处理坐标尺寸，或者可能如何将原始坐标尺寸应用到最终图像。

# read .tif
ximg = xarray.open_rasterio('path/to/tif')
print('1.', type(ximg), ximg.coords['x'].values)

# convert to hv.Dataset
r_ds = hv.Dataset(ximg[2,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
g_ds = hv.Dataset(ximg[1,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
b_ds = hv.Dataset(ximg[0,:,:], kdims=['x','y'], vdims='Value')
print('2.', type(r_ds), r_ds.dimension_values('x'))

# scale to uint8
r = np.squeeze((r_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
g = np.squeeze((g_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
b = np.squeeze((b_ds.data.to_array().astype(np.float64)/8190)*255).astype('uint8')
print('3.', type(r), r.coords['x'].values)

# combine to RGB
dstack = np.dstack([r, g, b]) # lose coordinate dimensions here
print('4.', type(dstack), 'NO COORDS')
rgb = hv.RGB(dstack, kdims=['x','y'])
print('5.', type(rgb), rgb.dimension_values('x'))

1. <class 'xarray.core.dataarray.DataArray'> [557989.5 557992.5 557995.5 ... 563194.5 563197.5 563200.5]
2. <class 'holoviews.core.data.Dataset'> [557989.5 557989.5 557989.5 ... 563200.5 563200.5 563200.5]
3. <class 'xarray.core.dataarray.DataArray'> [557989.5 557992.5 557995.5 ... 563194.5 563197.5 563200.5]
4. <class 'numpy.ndarray'> NO COORDS
5. <class 'holoviews.element.raster.RGB'> [-0.49971231 -0.49971231 -0.49971231 ...  0.49971231  0.49971231
  0.49971231]

显示所需坐标的示例，使用从上面的 r_ds、g_ds 和 b_ds 创建的 HoloViews 图像：

显示不需要的坐标的示例，使用 HoloViews RGB，在上面命名为 rgb：

Answer 1

评论中提到的 Landsat 示例使用 (xdim, ydim, R, G, B, A) 形式的 data 参数，它将所需的 x/y 坐标应用于图像。

陆地卫星示例：http://datashader.org/topics/landsat.html

rgb = hv.RGB(
    (
        ximg['x'],
        ximg['y'],
        r.data[::-1],
        g.data[::-1],
        b.data[::-1]
    ),
    vdims=list('RGB')
)

Holoviews RGB 坐标

Holoviews RGB coordinates

python

python-xarray

holoviews