为什么 rmarkdown::render 中的 docx 和 html 的绘图大小不同？

Question

当尝试将图形从 Rmd 绘制到 Word 和 Docx 时，绘图大小不同，其中 docx 版本修剪了边缘。有什么办法可以防止这种情况发生吗？

这是一个最低限度地重现它的 Rmd。（在其他图中，效果要极端得多，但需要更多代码才能重现）

```{r}
library(gemtc)
example(gemtc)
forest(results)
```

rmarkdown::render("./test.Rmd", output_format="word_document", clean=F)

rmarkdown::render("./test.Rmd", output_format="html_fragment")

请注意右侧经过修剪的 CrI。

运行s 之间的绘图参数似乎不同（这是来自不同的绘图）：

par(no.readonly = T)

(docx)

## $pin
## [1] 3.76 2.16
## 
## $plt
## [1] 0.164 0.916 0.255 0.795

对比

(html)

## $pin
## [1] 5.76 3.16
## 
## $plt
## [1] 0.1171429 0.9400000 0.2040000 0.8360000
##

在同一个地块上。这导致在某些情况下 Word 的边缘被修剪得非常极端。

版本信息

R version 3.4.4 (2018-03-15)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 18.04.1 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3.7.1
LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/lapack/liblapack.so.3.7.1

locale:
 [1] LC_CTYPE=C.UTF-8           LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] knitr_1.21.1   rmarkdown_1.11 gemtc_0.8-2    coda_0.19-2   

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.0      lattice_0.20-38 digest_0.6.18   truncnorm_1.0-8
 [5] slam_0.1-43     plyr_1.8.4      grid_3.4.4      meta_4.9-3     
 [9] magrittr_1.5    evaluate_0.12   stringi_1.2.4   tools_3.4.4    
[13] stringr_1.3.1   igraph_1.2.2    xfun_0.4        compiler_3.4.4 
[17] pkgconfig_2.0.2 Rglpk_0.6-3     htmltools_0.3.6

更极端情况的说明性示例（与上面相同的命令，运行在同一个 Rmd 文件上，绘图来自 coda 包）

HTML 版本（正确） DOCX 版本（尺寸错误）

Answer 1

截断是由于绘图设备（png）太小。 R Markdown 根据输出格式使用不同的图形宽度默认值。使用默认选项 will produce 7 inch wide images, while images in docx output are only 5 inch wide per default 编织到 HTML。有问题的图对于所选的设备宽度来说太宽，导致意外截断。

您可以通过将 HTML 输出的图形宽度设置为 5 英寸来验证这一点。生成的图片会出现和docx一样的问题：

---
output:
  html_document:
    fig_width: 5
---

```{r}
library(gemtc)
example(gemtc)
forest(results)
```

因此，解决方法是在全局范围内选择更大的图形宽度

---
output:
  word_document:
    fig_width: 5.5
---

或分别针对每个地块：

```{r fig.width=5.5}
library(gemtc)
example(gemtc)
forest(results)
```

为什么 rmarkdown::render 中的 docx 和 html 的绘图大小不同？

Why does the plot size differ between docx and html in rmarkdown::render?

r

pandoc

knitr

r-markdown