DiagrammeR:根据数据框设计图表

DiagrammeR: Devise a graph from a dataframe

Objective(在R环境下):提取节点和边 从数据框中使用它们来建模图表!!

我正在尝试学习如何使用 DiagrammeR 或任何其他图形建模库以获得如下图所示的图形(您可以按照 link [The GRAPH1]) 来自数据框:

数据框:

a b c classes
1 2 0  a
0 0 2  b
0 1 0  c

我已经使用 DiagrammeR library 并通过这些命令 手动 定义了节点和边:

library(DiagrammeR)
egrViz("
digraph boxes_and_circles{
#add the node statement
node[shape=box]

a; b; c;
#add the nodge statement

a->a [label=1]; a-> b[label=2]; b->c[label=2]; c->b[label=1]



graph [nodesep=0.1]

}

  ")

你能帮我理解如何自动获取节点和边吗?提前谢谢你。

您可以使用 igraph 包执行此操作。您的数据框是一个邻接矩阵, igraph 包含一个将其制作成图形的函数。我下面的代码添加了一个布局,用于将顶点定位在您在示例图中指定的位置。

## Your data
df = read.table(text="a b c classes
1 2 0  a
0 0 2  b
0 1 0  c", 
header=TRUE)

library(igraph)

g = graph_from_adjacency_matrix(as.matrix(df[,1:3]), weighted=TRUE)
LO = matrix(c(0,0,0,3,2,1), ncol=2)
plot(g, layout=LO, edge.label=E(g)$weight, vertex.shape="rectangle",
    vertex.color="white", edge.curved=c(0,0,0.15,0.15))