R：来自 pROC 包的 AUC

Question

我最近遇到 pROC 包来获取 AUC。在帮助部分，他们给出了以下示例：

library("pROC")
data(aSAH)
auc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)

在上面，outcome 是 factor 而 s100b 是 numerical。

我的问题是 AUC 在这种情况下如何工作？它适用于什么阈值 s100b？还是无所谓？

编辑 1 上面的代码导致 AUC = 0.73。我怎么知道选择了哪个阈值来获得这个值？

Answer 1

auc function of pROC is the Area Under the ROC curve. Behind the scenes the function calls the roc函数中的AUC在前，所以你所做的相当于：

myroc <- roc(aSAH$outcome, aSAH$s100b)
auc(myroc)

ROC曲线是通过计算所有可能的阈值的灵敏度和特异性得到的。可以用plot函数可视化曲线，AUC显示为灰色：

plot(myroc, auc.polygon=TRUE)

R: AUC from pROC package