循环返回比预期更多的值和 NA

Question

我正在尝试模拟一些数据以估计样本量，但我的循环返回了意外结果。

我正在尝试从具有不同数量样本大小的生成值向量中对 a 进行采样，然后连接多个模拟的均值和标准差。

library(MCMCglmm)
library(tidyverse)

Est <- function(n, mean, sd, lower, upper, samp_min, samp_max, samp_int, nsim){

        Data <- round(rtnorm(n, mean, sd, lower, upper), digits = 0) # Create a vector to sample from

        Samp_size <- seq(samp_min, samp_max, samp_int) # Create vector of sample sizes

        # Set up enpty results data frames
        Results_samp <- data.frame()
        Results <- data.frame()

        for(i in 1:nsim){ ## Loop through number of simulations

        for (j in seq_along(Samp_size)) { # Loop through sample sizes
                Score <- sample(Data, j, replace = TRUE)
                Nsubj <- Samp_size[j]
                Mean <- mean(Score, na.rm = TRUE)
                SD <- sd(Score, na.rm = TRUE)
                Results_samp <- rbind(Results_samp, 
                                      data.frame(
                                              Nsubj,
                                              Mean,
                                              SD))
        }
        Results <- rbind(Results, Results_samp)   
        }

        Results
}

Test <- Est(n = 1000, mean = 55, sd = 37, lower = 0, upper = 100, 
            samp_min = 5, samp_max = 20, samp_int = 5, nsim = 5)

这将创建一个包含 60 行的数据框，我希望其中有 20 行（4 种样本大小的 5 次模拟），而对于 5 的样本大小，我总是会返回 NA。

谁能看出我错在哪里？

谢谢！

Answer 1

一般来说，用 rbind 动态增长 data.frame 是非常在 R 中做事的低效方式。几乎总是 better/faster 做你想做的事情的方法。

除此之外，就回答您的问题而言，让我们看一下嵌套 for 循环的简化版本

x1 <- data.frame()
x2 <- data.frame()
for (i in 1:5) {
    for (j in 1:4) x1 <- rbind(x1, data.frame(x1 = i, x2 = i^2))
    x2 <- rbind(x2, x1)
}

看看 x2 如何有 60 行？

原因是您从未重置 x1。如果我们解决这个问题

x1 <- data.frame()
x2 <- data.frame()
for (i in 1:5) {
    for (j in 1:4) x1 <- rbind(x1, data.frame(x1 = i, x2 = i^2))
    x2 <- rbind(x2, x1)
    x1 <- data.frame()
}

正如预期的那样，我们有 nrow(x2) = 20。

循环返回比预期更多的值和 NA

Loop returning more values than expected and NA's

simulation

r