使用 table1 创建摘要 table 时出错："invalid model formula in ExtractVars"

Question

我是第一次使用 table1 包。我正在尝试创建描述性统计

的摘要 table

这是我的代码

data <- read_excel("correct file path", 
                      skip= 1,) 


mydata <-  data[, -c(19:40)]
i <-  c(5:18)

mydata[, i] <- apply(mydata[, i],2, function(x) as.numeric(as.character(x))) 


mydata <-  na.omit(mydata)

table1::label(dat$Sex) <- "Sex"
table1::label(dat$Age) <- "Age"
table1::label(dat$SBP) <- "SBP"
table1::label(dat$DBP) <- "DBP"
table1::label(dat$BMI) <- "BMI"
table1::label(dat$WHR) <- "waist:Hip"
table1::label(dat$`LTM %`) <- "% Lean tissue mass"
table1::label(dat$`FM %`) <- "% Fat mass"

sumtab <- table1::table1(~Sex + Age + SBP + DBP + BMI + WHR + 'LTM %' + 'FM %' , data = dat)

我收到以下错误

Error in terms.formula(formula, data = data) : 
  invalid model formula in ExtractVars

我看不出我做错了什么

Answer 1

问题在于单引号 (')，请改用反引号

sumtab <- table1::table1(~Sex + Age + SBP + DBP + BMI +
            WHR + `LTM %` + `FM %` , data = dat)

使用可重现的例子

library(table1)
 table1(~ sex + age + wt  + 'LTM %', data=dat)

Error in terms.formula(formula, data = data) : invalid model formula in ExtractVars

单引号导致错误，如 OP 的 post

table1(~ sex + age + wt  + `LTM %`, data=dat)

-输出

数据

set.seed(24)
dat <- expand.grid(id=1:10, sex=c("Male", "Female"), treat=c("Treated", "Placebo"))
dat$age <- runif(nrow(dat), 10, 50)
dat$age[3] <- NA  # Add a missing value
dat$wt <- exp(rnorm(nrow(dat), log(70), 0.2))
dat$`LTM %` <-  sample(40:50, nrow(dat), replace = TRUE)
label(dat$sex) <- "Sex"
label(dat$age) <- "Age"
label(dat$treat) <- "Treatment Group"
label(dat$wt) <- "Weight"
label(dat$`LTM %`) <- "% Lean tissue mass"

使用 table1 创建摘要 table 时出错："invalid model formula in ExtractVars"

Error when creating summary table with table1: "invalid model formula in ExtractVars"

statistics

r

summary

数据