为 Cartopy 地图中的缺失数据指定非透明颜色
specify non-transparent color for missing data in Cartopy map
在使用 Cartopy 和 matplotlib 的 pcolormesh 制作地图时,我无法为缺失值指定颜色。我想让所有 "nan" 值都变成灰色,而不是 white/transparent。为此,我尝试使用 matplotlib 颜色图的 set_bad
方法,但这似乎破坏了 Cartopy。该问题触发了来自 Cartopy 的 UserWarning,但我不知道解决方法是什么。
这是一个甚至没有 nan 值但显示问题的示例:
import xarray as xr
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import cartopy.crs as ccrs
import matplotlib as mpl
import cartopy
import sys
print(f"PYTHON: {sys.version}") # PYTHON: 3.8.1 | packaged by conda-forge | (default, Jan 29 2020, 15:06:10) [Clang 9.0.1 ]
print(f" xarray {xr.__version__}") # xarray 0.14.1
print(f" numpy {np.__version__}") # numpy 1.17.3
print(f" matplotlib {mpl.__version__}") # matplotlib 3.1.2
print(f" cartopy {cartopy.__version__}") # cartopy 0.17.0
# construct fake data:
sig = np.sin(np.radians(np.linspace(-90, 90, 192)))
sig = np.tile(sig, [288,1]).T
darr = xr.DataArray(sig, dims=("lat", "lon"), coords={"lat":np.linspace(-90, 90, 192), "lon":np.linspace(0,360,288)})
# darr.plot.pcolormesh() # Looks fine.
# fig, ax = plt.subplots(subplot_kw={"projection":ccrs.PlateCarree()})
# lons, lats = np.meshgrid(darr['lon'], darr['lat'])
# ax.pcolormesh(lons, lats, darr, transform=ccrs.PlateCarree()) # Looks fine.
cm = plt.get_cmap("viridis")
cm.set_bad("gray")
fig, ax = plt.subplots(subplot_kw={"projection":ccrs.PlateCarree()})
lons, lats = np.meshgrid(darr['lon'], darr['lat'])
ax.pcolormesh(lons, lats, darr, transform=ccrs.PlateCarree()) # Right side of map is gray / userwarning triggered
用户警告是:"UserWarning: The colormap's 'bad' has been set, but in order to wrap pcolormesh across the map it must be fully transparent."
所以警告很明显,结果是一张地图有一半的数据被遮盖了。我的问题是如何解决 Cartopy 的这个限制?
试试有问题的代码行
cm.set_bad("gray")
和
cm.set_bad( "gray", alpha=0 )
表示 "fully transparent" 的 alpha 参数应该可以解决您的问题。
在使用 Cartopy 和 matplotlib 的 pcolormesh 制作地图时,我无法为缺失值指定颜色。我想让所有 "nan" 值都变成灰色,而不是 white/transparent。为此,我尝试使用 matplotlib 颜色图的 set_bad
方法,但这似乎破坏了 Cartopy。该问题触发了来自 Cartopy 的 UserWarning,但我不知道解决方法是什么。
这是一个甚至没有 nan 值但显示问题的示例:
import xarray as xr
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import cartopy.crs as ccrs
import matplotlib as mpl
import cartopy
import sys
print(f"PYTHON: {sys.version}") # PYTHON: 3.8.1 | packaged by conda-forge | (default, Jan 29 2020, 15:06:10) [Clang 9.0.1 ]
print(f" xarray {xr.__version__}") # xarray 0.14.1
print(f" numpy {np.__version__}") # numpy 1.17.3
print(f" matplotlib {mpl.__version__}") # matplotlib 3.1.2
print(f" cartopy {cartopy.__version__}") # cartopy 0.17.0
# construct fake data:
sig = np.sin(np.radians(np.linspace(-90, 90, 192)))
sig = np.tile(sig, [288,1]).T
darr = xr.DataArray(sig, dims=("lat", "lon"), coords={"lat":np.linspace(-90, 90, 192), "lon":np.linspace(0,360,288)})
# darr.plot.pcolormesh() # Looks fine.
# fig, ax = plt.subplots(subplot_kw={"projection":ccrs.PlateCarree()})
# lons, lats = np.meshgrid(darr['lon'], darr['lat'])
# ax.pcolormesh(lons, lats, darr, transform=ccrs.PlateCarree()) # Looks fine.
cm = plt.get_cmap("viridis")
cm.set_bad("gray")
fig, ax = plt.subplots(subplot_kw={"projection":ccrs.PlateCarree()})
lons, lats = np.meshgrid(darr['lon'], darr['lat'])
ax.pcolormesh(lons, lats, darr, transform=ccrs.PlateCarree()) # Right side of map is gray / userwarning triggered
用户警告是:"UserWarning: The colormap's 'bad' has been set, but in order to wrap pcolormesh across the map it must be fully transparent."
所以警告很明显,结果是一张地图有一半的数据被遮盖了。我的问题是如何解决 Cartopy 的这个限制?
试试有问题的代码行
cm.set_bad("gray")
和
cm.set_bad( "gray", alpha=0 )
表示 "fully transparent" 的 alpha 参数应该可以解决您的问题。