在 Cytoscape 中合并多个网络时创建的 'container' 节点是什么?
What is the 'container' node create on merging multiple networks in Cytoscape?
我使用 Cytoscape 合并了从 KEGG 获得的 190 个网络。合并后的网络有一个名为 'container' 的节点,它与其他几个节点的连接非常紧密。节点 'container' 不是来自原始路径文件。这个节点代表什么,有什么意义?
我很确定这也不是来自 Cytoscape 的合并工具。我最好的猜测是你的一些通路有 "container" 个节点包裹着一个复合体或一组基因。在合并期间,这些都将成为同一个节点。即使您在网络视图中没有看到 "container" 节点,请检查它是否出现在节点 table 的任何位置。
-- 滑板车
我使用 Cytoscape 合并了从 KEGG 获得的 190 个网络。合并后的网络有一个名为 'container' 的节点,它与其他几个节点的连接非常紧密。节点 'container' 不是来自原始路径文件。这个节点代表什么,有什么意义?
我很确定这也不是来自 Cytoscape 的合并工具。我最好的猜测是你的一些通路有 "container" 个节点包裹着一个复合体或一组基因。在合并期间,这些都将成为同一个节点。即使您在网络视图中没有看到 "container" 节点,请检查它是否出现在节点 table 的任何位置。
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