当使用 customjs 回调更改时，Bokeh-Source 未正确更新绘图上的所有行

Question

我有一个集中运行 22 个元素的数据框。它的结构是这样的

      run           9Be       45Sc    .....
3/24/16 Run A      0.9280     nan
3/24/16 Run B      1.1052     0.4904
4/6/16 Run A       0.490      0.3374

对于每个元素，我需要绘制运行浓度以及该元素的平均值和标准偏差（实线）。我想制作一个散景图，我可以在其中 select table 中的一个元素，并且该图将使用该元素的数据进行更新。代码如下

os.chdir(r'')


low=pd.read_excel(r"", sheet_name="QC LOW", skiprows=5, usecols=range(0,34))
low["run"]=low["run"].astype(str)
low.loc[~(low["run"].str.contains("A")) & ~(low["run"].str.contains("B")),"run"]=pd.to_datetime(low.loc[(~low["run"].str.contains("A")) & (~low["run"].str.contains("B")),"run"]).dt.strftime('%m/%d/%y')
cols=low.columns.tolist()
cols=cols[2:]

select = Select(title="Option:", value="9Be", options=cols)

source=ColumnDataSource(data=low)

#Using 9Be as default. Will be changed when updated
mean=source.data['9Be'].mean()
plus_three_sigma=mean+(source.data['9Be'].std()*3)
minus_three_sigma=mean-(source.data['9Be'].std()*3)
plus_two_sigma=mean+(source.data['9Be'].std()*2)
minus_two_sigma=mean-(source.data['9Be'].std()*2)

tips=[("Run", "@Run"),("Concentration", "$y")]
p = figure(plot_width=1300, plot_height=800, x_range=source.data["run"], tooltips=tips, title="QC Low", x_axis_label="Run ID",y_axis_label="Concentration ng/mL")
p.line(x=source.data["run"], y=mean, line_width=1, color="black")
p.line(x=source.data["run"], y=plus_three_sigma, line_width=1, color="red")
p.line(x=source.data["run"], y=minus_three_sigma, line_width=1, color="red")
p.line(x=source.data["run"], y=minus_two_sigma, line_width=1, color="green",line_dash="dashed")
p.line(x=source.data["run"], y=plus_two_sigma, line_width=1, color="green",line_dash="dashed")
pc=p.circle(x='run', y="9Be",source=source)
p.xaxis.major_label_orientation = 1.2

callback = CustomJS(args=dict(source=source), code="""
    var data=source.data;
    data['9Be'] = data[cb_obj.value];
    source.change.emit();
""")

output_file("output.html")


select.js_on_change('value', callback)

show(row(select,p))

目前，散点图在 selecting 元素时正确更新...大部分时间（它并不总是更新。例如，如果我 select 一个元素然后尝试 select 9再一次）。但我的主要问题是，即使源应该改变，方法和标准偏差也没有更新？

Answer 1

您正在使用使用 show 创建的静态 HTML 文件，但您需要在当前项目更改时运行 Python 编码。要么你必须提前运行 Python 计算所有列的平均值和其他参数的代码，并将它们存储起来以备后用 CustomJS.code，或者您必须使用 bokeh serve 才能运行 Python 回调以响应某些用户操作。

您的代码的另一个问题是您更改了 CustomJS.code 中的数据。不要那样做——您只是在覆盖 9Be 值，完全丢失它们。相反，保存每个渲染器（从 p.line、p.circle 等返回的值），将渲染器传递给 CustomJS.args（就像 source 一样，您必须提供他们的一些名字），并更新相关字段而不是更新数据。在 CustomJS.code:

中应该看起来像这样

pc.glyph.y = {field: cb_obj.value};

BokehJS 需要 {field: ...} 部分 - 它由 Boken 在 Python 端自动为您创建，但您必须在 CustomJS.code 中手动应用它。对于静态值，比如预先计算的平均值，它会是这样的：

mean_renderer.glyph.y = {value: current_mean};

如何存储 current_mean 由您决定。您可以将所有预先计算的方法存储在例如另一个数据源，只需使用 {field: ...} 更改列名称，而不是使用 {value: ...}.

更改值

当使用 customjs 回调更改时，Bokeh-Source 未正确更新绘图上的所有行

Bokeh-Source not updating for all lines on plot correctly when changed with customjs callback

python

python-3.x

pandas

bokeh