如何使用 GUI select cytoscape 中两个 selected 节点之间的所有边
how to select all edges between two selected nodes in cytoscape using the GUI
有谁知道如何使用 GUI select cytoscape 中两个 selected 节点之间的所有边?
如果它是一个小型网络,这将很容易手动完成,但在我的例子中,有超过 10k 个节点。
理想情况下,我想要 select 70 个节点列表之间的所有边。
谢谢。
好吧,令我惊讶的是,答案是“否”,我不知道 select 边连接两个节点的简单方法。不过,我有一种可行的“hacky”方法:
- Select你想要的所有节点
- 执行文件->新网络->从Selected节点,所有边。这将为您提供一个新网络,其中只有 selected 个节点和连接它们的边。现在,将所有这些边的“共享交互”列更改为唯一的内容(例如 Select)。此列在您创建的子网和原始网络之间共享。
- 现在,回到原始网络,可以使用“过滤器”面板创建一个列过滤器,以查找具有“Select”共享交互的所有边。然后他们将被 selected.
可能比您想要的复杂得多,但它可以完成工作。我还建议为连接 selected 节点的 selecting 边添加功能请求(帮助->报告错误)。
有谁知道如何使用 GUI select cytoscape 中两个 selected 节点之间的所有边?
如果它是一个小型网络,这将很容易手动完成,但在我的例子中,有超过 10k 个节点。 理想情况下,我想要 select 70 个节点列表之间的所有边。
谢谢。
好吧,令我惊讶的是,答案是“否”,我不知道 select 边连接两个节点的简单方法。不过,我有一种可行的“hacky”方法:
- Select你想要的所有节点
- 执行文件->新网络->从Selected节点,所有边。这将为您提供一个新网络,其中只有 selected 个节点和连接它们的边。现在,将所有这些边的“共享交互”列更改为唯一的内容(例如 Select)。此列在您创建的子网和原始网络之间共享。
- 现在,回到原始网络,可以使用“过滤器”面板创建一个列过滤器,以查找具有“Select”共享交互的所有边。然后他们将被 selected.
可能比您想要的复杂得多,但它可以完成工作。我还建议为连接 selected 节点的 selecting 边添加功能请求(帮助->报告错误)。