在 awk 中以特定方式重命名第一列

Question

这是我的输入文件

900 mgdg molecules in water t= 953400.00000 step= 635600000
177255
    1BGL     C5    1   4.977  15.059   2.068
    1BGL     H5    2   5.025  15.020   2.158
    1BGL     O5    3   4.881  14.948   2.052
...(a lot of lines between)
...
    4LIN    HI216099   1.909  19.279   7.886
    4LIN    HI316100   1.849  19.417   7.987 (the last line, which I want to modify is 116102)
...
...
20389SOL    HW177254   0.325   8.307   3.850
20389SOL    HW277255   0.245   8.235   3.957
   5.75588  25.65343  12.14665

我的输出文件应该是这样的

900 mgdg molecules in water t= 953400.00000 step= 635600000
177255
    1MGD     C5    1   4.977  15.059   2.068
    1MGD     H5    2   5.025  15.020   2.158
    1MGD     O5    3   4.881  14.948   2.052
...(a lot of lines between)
...
  900MGD    HI216099   1.909  19.279   7.886
  900MGD    HI316100   1.849  19.417   7.987 (the last line, which I want to modify is 116102)
...
...
20389SOL    HW177254   0.325   8.307   3.850
20389SOL    HW277255   0.245   8.235   3.957
   5.75588  25.65343  12.14665

我只想修改 100 个文件中的第一列。每 129 行我就增加了价值。例如，第一列中的第 3-131 行有 1MGD，然后是第 132-260 行 - 2MGD，直到 116102 行。

这是我的脚本，但没有用

#!/bin/bash
for index in {1..100} 
do
    awk 'BEGIN { grp = 129 }
        {if (NR>=3 && NR<=116102) { 

        for (i=1; i<=116102; i++) {
                     = (int($i/grp)+1)"MGD"
        }
        }; print [=12=]}' eq15_$index.gro | tee eq2_15_$index.gro
done

你能帮帮我吗？

Answer 1

awk 'NR>=3 && NR<=116102{ x=int((NR-3)/129+1); =x"MGD" }1' file

测试：

您必须设置 start-end NR 和除数来定义它。例如这个测试文件：

900 mgdg molecules in water t= 953400.00000 step= 635600000
177255
    1BGL     C5    1   4.977  15.059   2.068
    1BGL     H5    2   5.025  15.020   2.158
    1BGL     O5    3   4.881  14.948   2.052
    1BGL     C5    1   4.977  15.059   2.068
    1BGL     H5    2   5.025  15.020   2.158
    1BGL     O5    3   4.881  14.948   2.052
    1BGL     O5    3   4.881  14.948   2.052
    4LIN    HI216099   1.909  19.279   7.886
    4LIN    HI316100   1.849  19.417   7.987 (the last line, which I want to modify
20389SOL    HW177254   0.325   8.307   3.850
20389SOL    HW277255   0.245   8.235   3.957
   5.75588  25.65343  12.14665

每 3 行修改第 3-11 行：

> awk 'NR>=3 && NR<=11{ x=int( (NR-3)/3+1); = x"MGD"}1' file
900 mgdg molecules in water t= 953400.00000 step= 635600000
177255
1MGD C5 1 4.977 15.059 2.068
1MGD H5 2 5.025 15.020 2.158
1MGD O5 3 4.881 14.948 2.052
2MGD C5 1 4.977 15.059 2.068
2MGD H5 2 5.025 15.020 2.158
2MGD O5 3 4.881 14.948 2.052
3MGD O5 3 4.881 14.948 2.052
3MGD HI216099 1.909 19.279 7.886
3MGD HI316100 1.849 19.417 7.987 (the last line, which I want to modify
20389SOL    HW177254   0.325   8.307   3.850
20389SOL    HW277255   0.245   8.235   3.957
   5.75588  25.65343  12.14665

此外，切勿在同一文件中使用 bash 循环和 awk。一个 awk.

就可以完成

在 awk 中以特定方式重命名第一列

Rename first column in specific way in awk

awk

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