igraph ggraph r 中的颜色节点

Question

我想根据原始数据框中的属性为图形的节点着色。但我想我还没有把那个审美变量“带入”到图表中。

此处的示例有效：

library(dplyr)
library(igraph)
library(ggraph)

data <-
  tibble(
    from = c("a", "a", "a", "b", "b", "c"),
    to = c(1, 2, 3, 1, 4, 2),
    type = c("X", "Y", "Y", "X", "Y", "X")
  )

graph <-
  graph_from_data_frame(data)

ggraph(graph,
       layout = "fr") +
  geom_node_point() +
  geom_edge_link()

我想要 geom_node_point(aes(color = type)) 之类的东西，但没有在图表中找到类型？

Answer 1

这里的问题是您将 type 列添加为 edge-attribute，而 geom_node_point 需要 vertex-attribute（参见 ?graph_from_data_frame：附加列被视为边缘属性。)。另一个问题是 type 对于任一节点列都不一致（例如 a 与类型 X 以及 Y 相关联，节点 [=18= 也是如此]).

要解决第一个问题，您可以将额外的顶点信息添加到 graph_from_data_frame 函数的 vertices 参数中。

解决这两个问题的最简单方法是在创建图表后添加类型属性：

 data <-
  tibble(
    from = c("a", "a", "a", "b", "b", "c"),
    to = c(1, 2, 3, 1, 4, 2)
  )

graph <- graph_from_data_frame(data)
V(graph)$type <- bipartite.mapping(graph)$type

bipartite.mapping 函数将 TRUE 或 FALSE 一致地添加到不同类型的每个顶点。

igraph ggraph r 中的颜色节点

color nodes in igraph ggraph r

r

igraph

nodes

ggraph