Julia DataFrames - 如何进行单热编码?

Julia DataFrames - How to do one-hot encoding?

我正在使用 Julia 的 DataFrames.jl 包。在其中,我有一个数据框,其中包含一个包含字符串列表的列(例如 ["Type A", "Type B", "Type D"])。然后如何执行单热编码?我无法在 DataFrames.jl 包中找到预建函数。

这是我想做的事的一个例子:

Original Dataframe

col1 | col2 |
102  |[a]   |
103  |[a,b] | 
102  |[c,b] |
After One-hot encoding

col1 | a | b | c |
102  | 1 | 0 | 0 |
103  | 1 | 1 | 0 | 
102  | 0 | 1 | 1 |

DataFrames.jl 中确实没有 one-hot 编码函数 - 我认为这是明智的,因为这是一个特殊的机器学习转换,应该存在于 ML 包中而不是一个基本的 DataFrames 包。

我认为你有两个选择:

  1. 使用可以为您完成此操作的 ML 包,例如MLJ.jl. In MLJ, the OneHotEncoder is a model that transforms any table with Finite features in it into a one-hot encoded version of itself, see the docs here

  2. 使用一个回归包,它使用 StatsModels @formula API 自动为分类变量生成虚拟列 - 如果你用例如拟合回归GLM.jl 并且您的公式是 @formula(y ~ x) 其中 x 是一个分类变量,模型矩阵将通过对比编码 x 自动构建,即除一个之外的所有列都具有二进制虚拟列x

    的水平

对于第二个选项,理想情况下您希望数据是分类的(尽管字符串也可以),为此 DataFrames.jl 包含 categorical! 函数。

编辑 2021 年 11 月 17 日:此后在 Julia Discourse 上有一个明确的主题,其中包含关于执行 one-hot 编码的广泛建议列表:https://discourse.julialang.org/t/all-the-ways-to-do-one-hot-encoding/

从那里分享我最喜欢的:

julia> x = [1, 2, 1, 3, 2];

julia> unique(x) .== permutedims(x)
3×5 BitMatrix:
 1  0  1  0  0
 0  1  0  0  1
 0  0  0  1  0

使用我们提供的基本功能很容易做到:

julia> df = DataFrame(x=rand([1:3;missing], 20))
20×1 DataFrame
│ Row │ x       │
│     │ Int64?  │
├─────┼─────────┤
│ 1   │ 1       │
│ 2   │ 2       │
│ 3   │ missing │
│ 4   │ 1       │
│ 5   │ 3       │
│ 6   │ missing │
│ 7   │ 3       │
│ 8   │ 3       │
│ 9   │ 3       │
│ 10  │ 3       │
│ 11  │ missing │
│ 12  │ 1       │
│ 13  │ 3       │
│ 14  │ 3       │
│ 15  │ 3       │
│ 16  │ 1       │
│ 17  │ missing │
│ 18  │ 1       │
│ 19  │ 1       │
│ 20  │ missing │

julia> ux = unique(df.x); transform(df, @. :x => ByRow(isequal(ux)) .=> Symbol(:x_, ux))
20×5 DataFrame
│ Row │ x       │ x_1  │ x_2  │ x_missing │ x_3  │
│     │ Int64?  │ Bool │ Bool │ Bool      │ Bool │
├─────┼─────────┼──────┼──────┼───────────┼──────┤
│ 1   │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 2   │ 2       │ 0    │ 1    │ 0         │ 0    │
│ 3   │ missing │ 0    │ 0    │ 1         │ 0    │
│ 4   │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 5   │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 6   │ missing │ 0    │ 0    │ 1         │ 0    │
│ 7   │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 8   │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 9   │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 10  │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 11  │ missing │ 0    │ 0    │ 1         │ 0    │
│ 12  │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 13  │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 14  │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 15  │ 3       │ 0    │ 0    │ 0         │ 1    │
│ 16  │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 17  │ missing │ 0    │ 0    │ 1         │ 0    │
│ 18  │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 19  │ 1       │ 1    │ 0    │ 0         │ 0    │
│ 20  │ missing │ 0    │ 0    │ 1         │ 0    │

编辑:

另一个例子:

julia> df = DataFrame(col1=102:104, col2=[["a"], ["a","b"], ["c","b"]])
3×2 DataFrame
│ Row │ col1  │ col2       │
│     │ Int64 │ Array…     │
├─────┼───────┼────────────┤
│ 1   │ 102   │ ["a"]      │
│ 2   │ 103   │ ["a", "b"] │
│ 3   │ 104   │ ["c", "b"] │

julia> ux = unique(reduce(vcat, df.col2))
3-element Array{String,1}:
 "a"
 "b"
 "c"

julia> transform(df, :col2 .=> [ByRow(v -> x in v) for x in ux] .=> Symbol.(:col2_, ux))
3×5 DataFrame
│ Row │ col1  │ col2       │ col2_a │ col2_b │ col2_c │
│     │ Int64 │ Array…     │ Bool   │ Bool   │ Bool   │
├─────┼───────┼────────────┼────────┼────────┼────────┤
│ 1   │ 102   │ ["a"]      │ 1      │ 0      │ 0      │
│ 2   │ 103   │ ["a", "b"] │ 1      │ 1      │ 0      │
│ 3   │ 104   │ ["c", "b"] │ 0      │ 1      │ 1      │

我已经包含了一个基于@Bogumil 代码的热门函数

https://github.com/xiaodaigh/DataConvenience.jl#one-hot-encoding

随心所欲

onehot(df, :col2)

完整的 MWE

a = DataFrame(
  player1 = ["a", "b", "c"],
  player2 = ["d", "c", "a"]
)

# does not modify a
onehot(a, :player1)

# modfies a
onehot!(a, :player1)