从大型数据集中的对列中选择最后一个有效数据日期

Pick last valid data dates from pair columns in a large dataset

我有一个如下所示的数据框,其中第一列包含日期,其他列包含这些日期的数据:

         date  k1-v1  k1-v2  k2-v1  k2-v2  k1k3-v1  k1k3-v2  k4-v1  k4-v2
0  2021-01-05    2.0    7.0    NaN    NaN      NaN      NaN    9.0    6.0
1  2021-01-31    NaN    NaN    8.0    5.0      NaN      NaN    7.0    6.0
2  2021-02-15    9.0    5.0    NaN    3.0      4.0      NaN    NaN    NaN
3  2021-02-28    NaN    9.0    0.0    1.0      NaN      NaN    8.0    8.0
4  2021-03-20    7.0    NaN    NaN    NaN      NaN      NaN    NaN    NaN
5  2021-03-31    NaN    NaN    8.0    NaN      3.0      NaN    8.0    0.0
6  2021-04-10    NaN    NaN    7.0    6.0      NaN      NaN    NaN    9.0
7  2021-04-30    NaN    6.0    NaN    NaN      NaN      NaN    1.0    NaN
8  2021-05-14    8.0    NaN    3.0    3.0      4.0      NaN    NaN    NaN
9  2021-05-31    NaN    NaN    2.0    1.0      NaN      NaN    NaN    NaN

列总是成对出现:(k1-v1, k1-v2);(k2-v1, k2-v2);(k1k3-v1, k1k3-v2) 等等 N 对。但是这对列并不总是按该顺序排列。所以k1-v1后面不一定只有k1-v2,而是会有k1-v2 数据框中某处的列。为简单起见,我并排展示了它们。

我需要在每对列中找到最后有效数据date,并总结如下所示:

   keys     v1-last     v2-last
0    k1  2021-05-14  2021-04-30
1    k2  2021-05-31  2021-05-31
2  k1k3  2021-05-14         NaN
3    k4  2021-04-30  2021-04-10

因此对于 (k1-v1) 最后有效数据是日期 2021-05-148.0,因为(k2-v2) 6.02021-04-30v1-lastv2-last 中的列相应地填充了 k1,其他人也是如此。

目前我正在这样做,这在较大的数据集上不是很有效:

df.set_index('date', inplace=True)
unique_cols = set([col[0] for col in df.columns.str.split('-')])
summarized_data = []
for col in unique_cols:
    pair_df = df.loc[:,[col+'-v1',col+'-v2']].dropna(how='all')
    v1_last_valid = pair_df.iloc[:,0].last_valid_index()
    v2_last_valid = pair_df.iloc[:,1].last_valid_index()
    summarized_data.append([col, v1_last_valid, v2_last_valid])

summarized_df = pd.DataFrame(summarized_data, columns=['keys','v1-last','v2-last'])

这目前有效,并给出了预期的结果,但在大数据集上 运行 时会花费大量时间。是否可以避免循环并以不同且有效的方式完成?

我们可以颠倒列名并使用 pd.wide_to_long,其中存根名称为 v_j,标识符为 date,我们将 k* 称为 keys 在结果中。然后我们可以 groupby keys 并聚合 DataFrame.last_valid_index:

# reverse the column names
df.columns = df.columns.str.replace(r"(\w+)-(\w+)", r"-", regex=True)

# wide to long (and then make `keys` a column with reset_index)
long = pd.wide_to_long(df, stubnames=["v1", "v2"], i="date", j="keys",
                       sep="-", suffix=r"\w+").reset_index("keys")

# get the last valid dates & add a suffix
result = (long.groupby("keys")
              .agg(pd.DataFrame.last_valid_index)
              .add_suffix("-last"))
        

得到

>>> result

         v1-last     v2-last
keys
k1    2021-05-14  2021-04-30
k1k3  2021-05-14        None
k2    2021-05-31  2021-05-31
k4    2021-04-30  2021-04-10


要使 v_j 的存根名称更通用:

stubnames = df.columns.str.extract(r"^(\w+)-", expand=False).dropna().unique()
# Index(["v1", "v2"], dtype="object")

重命名该列,然后使用 wide_to_long 重组数据框。 Stack 删除 NAN。然后使用groupby-agg提取最后一个值。

df2 = (
    pd.wide_to_long(
        df2.rename(columns=(lambda x: ''.join(x.split('-')[::-1]))),
        stubnames=['v2', 'v1'],
        i='date',
        j='keys',
        suffix='.*'
    ).stack()
    .reset_index(0)
    .groupby(level=[0, 1])
    .agg({'date': 'last'})
    .unstack(-1)
).add_suffix('-last')

df2.columns = df2.columns.droplevel()

输出:

         v2-last     v1-last
keys                        
k1    2021-04-30  2021-05-14
k1k3         NaN  2021-05-14
k2    2021-05-31  2021-05-31
k4    2021-04-10  2021-04-30

解决方案

s = df.set_index('date').stack()
s = s.reset_index().drop_duplicates('level_1', keep='last')
s[['keys', 'val']] = s['level_1'].str.split('-', expand=True)
s = s.pivot('keys', 'val', 'date').add_suffix('-last')

解释

将数据帧的索引设置为 datestack 以重塑

date               
2021-01-05  k1-v1      2.0
            k1-v2      7.0
            k4-v1      9.0
            k4-v2      6.0
2021-01-31  k2-v1      8.0
            k2-v2      5.0
            k4-v1      7.0
            k4-v2      6.0
...
2021-05-31  k2-v1      2.0
            k2-v2      1.0
dtype: float64

重置索引并删除 level_1

中具有重复值的行
          date  level_1    0
24  2021-04-10    k4-v2  9.0
25  2021-04-30    k1-v2  6.0
26  2021-04-30    k4-v1  1.0
27  2021-05-14    k1-v1  8.0
30  2021-05-14  k1k3-v1  4.0
31  2021-05-31    k2-v1  2.0
32  2021-05-31    k2-v2  1.0

Split level_1 列中的字符串以创建另外两个列 keysval

          date  level_1    0  keys val
24  2021-04-10    k4-v2  9.0    k4  v2
25  2021-04-30    k1-v2  6.0    k1  v2
26  2021-04-30    k4-v1  1.0    k4  v1
27  2021-05-14    k1-v1  8.0    k1  v1
30  2021-05-14  k1k3-v1  4.0  k1k3  v1
31  2021-05-31    k2-v1  2.0    k2  v1
32  2021-05-31    k2-v2  1.0    k2  v2

Pivot 要重塑并向列名称添加后缀 -last 的数据框

val      v1-last     v2-last
keys                        
k1    2021-05-14  2021-04-30
k1k3  2021-05-14         NaN
k2    2021-05-31  2021-05-31
k4    2021-04-30  2021-04-10

首先,定义一个函数来获取任何给定列名所需的日期:

def last_date(col):
    idx = df[col].last_valid_index()
    return df.loc[idx, 'date'] if idx is not None else np.nan

然后将键分组到字典中,并使用它来构建生成的数据框:

keys = {}
for col in df.columns[1:]:
    key, vn = col.split('-')
    keys.setdefault(key, [None]*2)[int(vn[-1])-1] = last_date(col)

pd.DataFrame.from_records([[k] + dt_list for k, dt_list in keys.items()], columns=['keys', 'v1-last', 'v2-last'])

这会产生所需的输出:

   keys     v1-last     v2-last
0    k1  2021-05-14  2021-04-30
1    k2  2021-05-31  2021-05-31
2  k1k3  2021-05-14         NaN
3    k4  2021-04-30  2021-04-10

结合@MustafaAydin 和@ShubhamSharma 的想法,我们可以做到这一点:

temp = df.set_index('date')

应用pd.Series.last_valid_index:

# you could use `agg` since it is a reducer
temp = temp.apply(pd.Series.last_valid_index)

将索引转换为 MultiIndex:

temp.index = temp.index.str.split("-", expand = True)

取消堆叠并添加后缀:

temp.unstack().add_suffix('_last')

         v1_last     v2_last
k1    2021-05-14  2021-04-30
k1k3  2021-05-14        None
k2    2021-05-31  2021-05-31
k4    2021-04-30  2021-04-10