通过 ssh 的多台机器的 snakemake（或并行）
snakemake (or parallel) for multiple machines over ssh
假设你有一个 snakemake 文件。此文件生成大约 50000 个作业，但是，这些都是需要几秒钟才能完成的小作业 运行。
从头节点，您可以访问多个名为：
的服务器
machine01
machine02
machine03
machine04
machine05
machine06
更有趣的是，每台机器的核数不均。将不同的作业发送到不同的机器以并行执行的最佳方法是什么？我在 snakemake 中尝试了批处理选项，但似乎没有用，但我认为可以。
对于 GNU Parallel，它可能看起来像这样：
cat arguments | parallel --slf list-of-servers my_script
如果服务器安装了 GNU Parallel，它会检测每个服务器上的内核数。
假设你有一个 snakemake 文件。此文件生成大约 50000 个作业，但是，这些都是需要几秒钟才能完成的小作业 运行。
从头节点，您可以访问多个名为：
的服务器machine01
machine02
machine03
machine04
machine05
machine06
更有趣的是，每台机器的核数不均。将不同的作业发送到不同的机器以并行执行的最佳方法是什么？我在 snakemake 中尝试了批处理选项，但似乎没有用，但我认为可以。
对于 GNU Parallel，它可能看起来像这样：
cat arguments | parallel --slf list-of-servers my_script
如果服务器安装了 GNU Parallel，它会检测每个服务器上的内核数。