使用 Dataframe 进行多处理和队列
Multiprocessing and Queue with Dataframe
我在通过队列在 2 个进程之间交换对象(数据帧)时遇到了一些麻烦。
第一个进程从队列中获取数据,第二个进程将数据放入队列中。
put-process 速度更快,所以 get-process 应该通过读取所有对象来清除队列。
我的行为很奇怪,因为我的代码运行得很好并且符合预期,但仅适用于数据框中的 100 行,对于 1000 行,get-process 始终只需要 1 个对象。
import multiprocessing, time, sys
import pandas as pd
NR_ROWS = 1000
i = 0
def getDf():
global i, NR_ROWS
myheader = ["name", "test2", "test3"]
myrow1 = [ i, i+400, i+250]
df = pd.DataFrame([myrow1]*NR_ROWS, columns = myheader)
i = i+1
return df
def f_put(q):
print "f_put start"
while(1):
data = getDf()
q.put(data)
print "P:", data["name"].iloc[0]
sys.stdout.flush()
time.sleep(1.55)
def f_get(q):
print "f_get start"
while(1):
data = pd.DataFrame()
while not q.empty():
data = q.get()
print "get"
if not data.empty:
print "G:", data["name"].iloc[0]
else:
print "nothing new"
time.sleep(5.9)
if __name__ == "__main__":
q = multiprocessing.Queue()
p = multiprocessing.Process(target=f_put, args=(q,))
p.start()
while(1):
f_get(q)
p.join()
100 行数据帧的输出,get-process 获取所有对象
f_get start
nothing new
f_put start
P: 0 # put 1.object into the queue
P: 1 # put 2.object into the queue
P: 2 # put 3.object into the queue
P: 3 # put 4.object into the queue
get # get-process takes all 4 objects from the queue
get
get
get
G: 3
P: 4
P: 5
P: 6
get
get
get
G: 6
P: 7
P: 8
输出 1000 行数据帧,get-process 只需要一个对象。
f_get start
nothing new
f_put start
P: 0 # put 1.object into the queue
P: 1 # put 2.object into the queue
P: 2 # put 3.object into the queue
P: 3 # put 4.object into the queue
get <-- #!!! get-process takes ONLY 1 object from the queue!!!
G: 1
P: 4
P: 5
P: 6
get
G: 2
P: 7
P: 8
P: 9
P: 10
get
G: 3
P: 11
知道我做错了什么以及如何传递更大的数据帧吗?
冒着无法完全提供功能齐全的示例的风险,这就是问题所在。
首先是时间问题
我用更大的 DataFrame(10000
甚至 100000
)再次尝试了你的代码,我开始看到和你一样的东西。这意味着一旦数组的大小超过某个阈值,您就会看到此行为,该阈值将取决于系统(CPU?)。
我稍微修改了您的代码,以便更容易地看到发生了什么。首先,5 DataFrames
是 put
进入队列,没有任何自定义 time.sleep
。在 f_get
函数中,我向循环 (while not q.empty()
) 添加了一个计数器(和一个 time.sleep(0)
,见下文)。
新代码:
import multiprocessing, time, sys
import pandas as pd
NR_ROWS = 10000
i = 0
def getDf():
global i, NR_ROWS
myheader = ["name", "test2", "test3"]
myrow1 = [ i, i+400, i+250]
df = pd.DataFrame([myrow1]*NR_ROWS, columns = myheader)
i = i+1
return df
def f_put(q):
print "f_put start"
j = 0
while(j < 5):
data = getDf()
q.put(data)
print "P:", data["name"].iloc[0]
sys.stdout.flush()
j += 1
def f_get(q):
print "f_get start"
while(1):
data = pd.DataFrame()
loop = 0
while not q.empty():
data = q.get()
print "get (loop: %s)" %loop
time.sleep(0)
loop += 1
time.sleep(1.)
if __name__ == "__main__":
q = multiprocessing.Queue()
p = multiprocessing.Process(target=f_put, args=(q,))
p.start()
while(1):
f_get(q)
p.join()
现在,如果你 运行 这对于不同的行数,你会看到这样的东西:
N=100:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 2)
get (loop: 3)
get (loop: 4)
N=10000:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 0)
get (loop: 0)
get (loop: 0)
这告诉我们什么?
只要 DataFrame
很小,您关于 put
进程比 get
更快的假设似乎是正确的,我们可以在 while not q.empty()
的一个循环中获取所有 5 个项目。
但是,随着行数的增加,情况发生了变化。 while 条件 q.empty()
的计算结果为 True
(队列为空)和外部 while(1)
循环。
这可能意味着 put
现在比 get
慢,我们必须等待。但是,如果我们将整个 f_get
的睡眠时间设置为类似 15
的值,我们仍然会得到相同的行为。
另一方面,如果我们将内部 q.get()
循环中的 time.sleep(0)
更改为 1,
while not q.empty():
data = q.get()
time.sleep(1)
print "get (loop: %s)" %loop
loop += 1
我们得到这个:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 2)
get (loop: 3)
get (loop: 4)
这看起来不错!这意味着实际上 get
做了一些奇怪的事情。看起来当它仍在处理 get
时,队列状态是 empty
,并且在 get
完成后下一个项目可用。
我确定这是有原因的,但我对 multiprocessing
不够熟悉,看不出这一点。
根据您的应用程序,您可以将适当的 time.sleep
添加到您的内部循环并查看是否足够。
或者,如果您想解决它(而不是使用变通方法作为 time.sleep
方法),您可以查看 multiprocessing
并查找有关 blocking、非阻塞 或 异步 通信 - 我认为可以在那里找到解决方案。
我在通过队列在 2 个进程之间交换对象(数据帧)时遇到了一些麻烦。
第一个进程从队列中获取数据,第二个进程将数据放入队列中。 put-process 速度更快,所以 get-process 应该通过读取所有对象来清除队列。
我的行为很奇怪,因为我的代码运行得很好并且符合预期,但仅适用于数据框中的 100 行,对于 1000 行,get-process 始终只需要 1 个对象。
import multiprocessing, time, sys
import pandas as pd
NR_ROWS = 1000
i = 0
def getDf():
global i, NR_ROWS
myheader = ["name", "test2", "test3"]
myrow1 = [ i, i+400, i+250]
df = pd.DataFrame([myrow1]*NR_ROWS, columns = myheader)
i = i+1
return df
def f_put(q):
print "f_put start"
while(1):
data = getDf()
q.put(data)
print "P:", data["name"].iloc[0]
sys.stdout.flush()
time.sleep(1.55)
def f_get(q):
print "f_get start"
while(1):
data = pd.DataFrame()
while not q.empty():
data = q.get()
print "get"
if not data.empty:
print "G:", data["name"].iloc[0]
else:
print "nothing new"
time.sleep(5.9)
if __name__ == "__main__":
q = multiprocessing.Queue()
p = multiprocessing.Process(target=f_put, args=(q,))
p.start()
while(1):
f_get(q)
p.join()
100 行数据帧的输出,get-process 获取所有对象
f_get start
nothing new
f_put start
P: 0 # put 1.object into the queue
P: 1 # put 2.object into the queue
P: 2 # put 3.object into the queue
P: 3 # put 4.object into the queue
get # get-process takes all 4 objects from the queue
get
get
get
G: 3
P: 4
P: 5
P: 6
get
get
get
G: 6
P: 7
P: 8
输出 1000 行数据帧,get-process 只需要一个对象。
f_get start
nothing new
f_put start
P: 0 # put 1.object into the queue
P: 1 # put 2.object into the queue
P: 2 # put 3.object into the queue
P: 3 # put 4.object into the queue
get <-- #!!! get-process takes ONLY 1 object from the queue!!!
G: 1
P: 4
P: 5
P: 6
get
G: 2
P: 7
P: 8
P: 9
P: 10
get
G: 3
P: 11
知道我做错了什么以及如何传递更大的数据帧吗?
冒着无法完全提供功能齐全的示例的风险,这就是问题所在。
首先是时间问题
我用更大的 DataFrame(10000
甚至 100000
)再次尝试了你的代码,我开始看到和你一样的东西。这意味着一旦数组的大小超过某个阈值,您就会看到此行为,该阈值将取决于系统(CPU?)。
我稍微修改了您的代码,以便更容易地看到发生了什么。首先,5 DataFrames
是 put
进入队列,没有任何自定义 time.sleep
。在 f_get
函数中,我向循环 (while not q.empty()
) 添加了一个计数器(和一个 time.sleep(0)
,见下文)。
新代码:
import multiprocessing, time, sys
import pandas as pd
NR_ROWS = 10000
i = 0
def getDf():
global i, NR_ROWS
myheader = ["name", "test2", "test3"]
myrow1 = [ i, i+400, i+250]
df = pd.DataFrame([myrow1]*NR_ROWS, columns = myheader)
i = i+1
return df
def f_put(q):
print "f_put start"
j = 0
while(j < 5):
data = getDf()
q.put(data)
print "P:", data["name"].iloc[0]
sys.stdout.flush()
j += 1
def f_get(q):
print "f_get start"
while(1):
data = pd.DataFrame()
loop = 0
while not q.empty():
data = q.get()
print "get (loop: %s)" %loop
time.sleep(0)
loop += 1
time.sleep(1.)
if __name__ == "__main__":
q = multiprocessing.Queue()
p = multiprocessing.Process(target=f_put, args=(q,))
p.start()
while(1):
f_get(q)
p.join()
现在,如果你 运行 这对于不同的行数,你会看到这样的东西:
N=100:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 2)
get (loop: 3)
get (loop: 4)
N=10000:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 0)
get (loop: 0)
get (loop: 0)
这告诉我们什么?
只要 DataFrame
很小,您关于 put
进程比 get
更快的假设似乎是正确的,我们可以在 while not q.empty()
的一个循环中获取所有 5 个项目。
但是,随着行数的增加,情况发生了变化。 while 条件 q.empty()
的计算结果为 True
(队列为空)和外部 while(1)
循环。
这可能意味着 put
现在比 get
慢,我们必须等待。但是,如果我们将整个 f_get
的睡眠时间设置为类似 15
的值,我们仍然会得到相同的行为。
另一方面,如果我们将内部 q.get()
循环中的 time.sleep(0)
更改为 1,
while not q.empty():
data = q.get()
time.sleep(1)
print "get (loop: %s)" %loop
loop += 1
我们得到这个:
f_get start
f_put start
P: 0
P: 1
P: 2
P: 3
P: 4
get (loop: 0)
get (loop: 1)
get (loop: 2)
get (loop: 3)
get (loop: 4)
这看起来不错!这意味着实际上 get
做了一些奇怪的事情。看起来当它仍在处理 get
时,队列状态是 empty
,并且在 get
完成后下一个项目可用。
我确定这是有原因的,但我对 multiprocessing
不够熟悉,看不出这一点。
根据您的应用程序,您可以将适当的 time.sleep
添加到您的内部循环并查看是否足够。
或者,如果您想解决它(而不是使用变通方法作为 time.sleep
方法),您可以查看 multiprocessing
并查找有关 blocking、非阻塞 或 异步 通信 - 我认为可以在那里找到解决方案。