使用多维数组分析 RNA 序列
Using multidimensional arrays to analyze sequences of RNA
我目前正在学习多维数组，任务是分析 RNA 序列链（来自 .txt 文件）。这是一个链的例子：
AUGCUUAUUAACUGAAAACAUAUGGGUAGUCGAUGA
根据这个字符串，我要弄清楚这条 RNA 链会产生什么蛋白质。为此，我要将每条链分解成密码子（3 组）。因此，对于这个例子，我需要查看 AUG CUU AUU AAC UGA 等。这些密码子中的每一个都代表一种氨基酸。所以 AUG 是甲硫氨酸（用 'M' 表示），CUU 是亮氨酸（用 'L' 表示）等等。因此，我的输出应该是一串新的氨基酸 (M-L-I...)
解决这个问题的最佳方法是什么？据我了解，我要创建一个 3-D 数组，比方说
int aminoAcid[4][4][4]
因为每个碱基 (A,U,G,C) 有 4 种可能的选择。我不完全确定从这里去哪里，因为某些组合会产生相同的氨基酸。
编辑：如果首先将字符串转换为数字表示形式（A=0、U=1、G=2、C=3），我的方向是否正确？从那里我可以更好地使用 3d 阵列，对吗？
您可以使用 3d 数组将氨基酸连接到不同的序列。您应该了解 enum 并弄清楚如何将 enum 与您的数组索引一起使用，以便您可以执行类似
的操作
aminoAcid['A']['U']['G'] = 24
其中 24 也对应蛋氨酸，这意味着您可以在那里使用另一个 enum。只要您想要用数字表示一组有限的已知项目，请使用 enums。
听起来这只是一个更大项目的开始，因此您应该从一开始就遵循良好做法，思考如何构建能够代表您的问题的组件。
我目前正在学习多维数组，任务是分析 RNA 序列链（来自 .txt 文件）。这是一个链的例子：
AUGCUUAUUAACUGAAAACAUAUGGGUAGUCGAUGA
根据这个字符串，我要弄清楚这条 RNA 链会产生什么蛋白质。为此，我要将每条链分解成密码子（3 组）。因此，对于这个例子，我需要查看 AUG CUU AUU AAC UGA 等。这些密码子中的每一个都代表一种氨基酸。所以 AUG 是甲硫氨酸（用 'M' 表示），CUU 是亮氨酸（用 'L' 表示）等等。因此，我的输出应该是一串新的氨基酸 (M-L-I...)
解决这个问题的最佳方法是什么？据我了解，我要创建一个 3-D 数组，比方说
int aminoAcid[4][4][4]
因为每个碱基 (A,U,G,C) 有 4 种可能的选择。我不完全确定从这里去哪里，因为某些组合会产生相同的氨基酸。
编辑：如果首先将字符串转换为数字表示形式（A=0、U=1、G=2、C=3），我的方向是否正确？从那里我可以更好地使用 3d 阵列，对吗？
您可以使用 3d 数组将氨基酸连接到不同的序列。您应该了解 enum 并弄清楚如何将 enum 与您的数组索引一起使用，以便您可以执行类似
aminoAcid['A']['U']['G'] = 24
其中 24 也对应蛋氨酸，这意味着您可以在那里使用另一个 enum。只要您想要用数字表示一组有限的已知项目，请使用 enums。
听起来这只是一个更大项目的开始，因此您应该从一开始就遵循良好做法，思考如何构建能够代表您的问题的组件。