使用 rJava 从 R 使用 Jackcess

Question

我对 Java 不太熟悉，但我尝试在 R 中完成此任务（我的最爱）！

有一个名为 Jackcess. I want to connect to this library and open an MS Access 2003 .mdb file in it. Jackcess cookbook 的 Java 库告诉我使用这个库的第一步是：

Database db = DatabaseBuilder.open(new File("mydb.mdb"));

或者如@Gord 所建议的，

File file = new File("C:/Users/Public/jackcessTest.mdb");
DatabaseBuilder dbbo = new DatabaseBuilder();
dbbo.setFile(file);
Database db = dbbo.open();

但我卡在了这第一步。

我已经安装了 Java 和 rJava 并设置了有关目录的所有内容。这是我在 R

中的代码

library(rJava)

.jinit()
.jaddClassPath("java/jackcess-2.1.2.jar") # there I have put the downloaded jar file of Jackcess

# .jaddClassPath("java/commons-logging-1.2.jar") # this is the commons-logging class that Jackcess depends on, commented to replicate problem 2] in my question.



file.name <- "D:/63.mdb" # some data base .mdb file (containing only tables)

file <- .jnew("java/io/File",file.name)
dbbo <- .jnew("com/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder")

[编辑：我发现我有两个问题，一个解决了，一个还没有。] 到目前为止一切正常，但从现在开始我遇到了一些问题：

1] 正确调用 Jackcess 的方法且签名不匹配，这些都不起作用：

dbbo <- .jcall(dbbo,"L<DatabaseBuilder>","setFile",file)
dbbo <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder","setFile",file)

我收到这个错误：

Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder",  : 
method setFile with signature (Ljava/io/File;)Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder not found

好吧，我找到了这一步的答案，我只需要在 class 定义字符串的末尾添加一个分号 (;)。

dbbo <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder;","setFile",file)

2]正确调用open方法，我的第一轮尝试：

 db <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;","open",evalArray = FALSE,evalString = FALSE)

我得到这个错误：

 Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;", "open",  : 
 java.lang.NoClassDefFoundError: org/apache/commons/logging/LogFactory

我用谷歌搜索发现 Jackcess 依赖于一些名为 commons-logging 的库，因此下载并将其添加到 classpath 解决了这个问题

3]正确调用open方法，我的第二轮尝试：with commons-logging in classpath

db <- .jcall(dbbo,"Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;","open",evalArray = FALSE,evalString = FALSE)

这给了我这个错误：

Error in .jcall(dbbo, "Lcom/healthmarketscience/jackcess/Database;", "open",  : 
java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class com.healthmarketscience.jackcess.impl.DatabaseImpl

对这个错误有什么想法吗？

[注意]：一些答案是在我编辑之前建议的，所以它们现在看起来无关紧要，但我在上面解释的步骤中使用了它们。

Answer 1

以下代码显示了 Java 中使用 "real" DatabaseBuilder 对象的 .setFile 和 .open 方法的替代方法：

File file = new File("C:/Users/Public/jackcessTest.mdb");
DatabaseBuilder dbbo = new DatabaseBuilder();
dbbo.setFile(file);
Database db = dbbo.open();

在 rJava 中尝试类似的东西，看看它是否适合你。

编辑回复：更新问题

您提到您添加了 Apache commons-logging to your CLASSPATH, but Jackcess also relies on Apache commons-lang v2.x（ 而不是 v3.x），因此尝试下载它并将其包含在您的 CLASSPATH 中还有。

Answer 2

3 条建议：

在您的类路径中包含 commons-lang-2.0.jar，类似于

rJava::.jaddClassPath("commons-lang-2.0.jar")

简单的方法是像这样尝试使用 J() 调用：

dbb <- rJava::.jnew("com/healthmarketscience/jackcess/DatabaseBuilder")
dbjfile <- rJava::.jnew('java/io/File', "D:/63.mdb")
dbop <- rJava::J(dbb, "open", dbjfile)

尽管如此，如果您真的想以低级方式进行操作，可以尝试以下方法：

dbop <- .jcall(
    "RJavaTools"
  , "Ljava/lang/Object;"
  , "invokeMethod"
  , .jcall(dbb, "Ljava/lang/Class;", "getClass")
  , .jcast(dbb, "java/lang/Object")
  , .jnew("java/lang/String", "open")
  , .jarray(list(dbjfile), "java/lang/Object", dispatch = FALSE)
  , .jarray(rJava:::._java_class_list(list(dbjfile)), "java/lang/Class", dispatch = FALSE)
  , use.true.class = TRUE
  , evalString = TRUE
  , evalArray = FALSE
  )

使用 rJava 从 R 使用 Jackcess

Use Jackcess from R using rJava

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