小的 ggplot 对象 (1 mb) 保存后变成 7 GB 的 .Rdata 对象

Question

我有一系列 ggplot 对象，我试图将它们保存到 .rdata 文件中，以便稍后加载到 Markdown 文档中。 ggplot 对象本身非常小（几 KB）。但是，当我尝试将对象保存为 .rdata 文件以供以后检索时，生成的 .rdata 文件现在超过 8 GB。我试过直接从 GUI 保存绘图，保存为 .rds...保存为 .pdf 或其他图像会生成几 KB 的普通图像。

我很困惑，有没有其他人遇到过这个问题？

下面的示例工作流程，我无法为该问题提供可重现的代码，因为我无法上传制作此图所需的数据框

mcmsy<- (ggplot(data = subset(MonteCarlo, Policy == 'RBFM' & 
Year == BaselineYear), aes(MSY), alpha = 0.8) + geom_density(fill = 'steelblue2'))

object.size(mcmsy)

save(mcmsy, file = 'mcmsy_plot.rdata')

Answer 1

我也偶然发现了这个问题。这确实与环境有关。如果您想将绘图保存为 Rdata 文件，那么您应该在生成绘图的函数内创建一个新环境，这样就不会保存完整的环境。示例：

makePlot <- function(plot.data){
  env <- new.env(parent = globalenv())
  env$subset <- plot.data

  my.plot <- with(env, {
    my.plot <- ggplot(subset, ...) 
    return(my.plot)
  })

  return(my.plot)
}

小的 ggplot 对象 (1 mb) 保存后变成 7 GB 的 .Rdata 对象

small ggplot object (1 mb) turns into 7 gigabyte .Rdata object when saved

r

save

ggplot2