转置数据帧 pandas

transposing dataframe pandas

我有以下文件格式:

SA BTSA01_U01 0 0 0 -9 G G T T    
SA BTSA01_U02 0 0 0 -9 G G T T

想用pandas转置它,下面是我试过的代码:

import pandas as pd from pandas import DataFrame 
  def transpose(file1,file2):
  source=pd.read_csv(file1,sep=None,engine='python')
  dest=source.transpose()
  dest.to_csv(file2)

但是并没有给我想要的输出,下面是输出:

0    
SA  SA    
BTSA01_U01  BTSA01_U02    
0   0    
0.1 0   
0.2 0    
-9  -9    
G   G    
G.1 G    
T   T    
T.1 T    

我尝试使用一些选项,例如 header=Falseindex=Falsedest.to_csv,但 none 有效,我想知道添加“.”和第一列中某些值中的“1”,

您没有指定 header=None,因此您的第一行被解释为列名,但这会生成不允许的重复名称,因此您会附加 .1

所以你需要:

source=pd.read_csv(file1,sep=None,engine='python', header=None)