在 Anaconda 中安装 Python 模块的开发版本的最佳做法是什么？

Question

我在 Mac 上使用 Anaconda python 发行版。我想使用最新版本的 matplotlib source code on Github，进行一些更改，然后看看它是如何运行的。但大多数时候我只是想使用 Anaconda Python 附带的普通版本的 matplotlib，所以我想要一种可以轻松来回切换的方法。

matplotlib 文档对 branching and pull-request workflow 有很好的描述，但我不清楚我如何实际安装和使用 matplotlib 的开发版本以保持我的工作 Python实施。

我的猜测是我想设置一个包含最新 matplotlib 版本及其依赖项的环境，并在该环境和正常 root 环境之间切换。但是当我使用python setup.py develop安装matplotlib的开发版本时，它似乎安装到两个环境。

那么，使用来自 GitHub 的 Python 包的开发版本的最佳实践是什么？

Answer 1

正如您在问题中提到的，conda env 能够为您要处理的任何软件包的开发版本维护单独的 Python 环境。

我不太确定为什么您发现 python setup.py develop 正在将 matplotlib 的开发版本安装到您的 root 环境中。也许您创建了一个新环境，但在安装开发版 matplotlib 之前没有激活它？例如：

~$ conda create --name matplotlib-dev --clone root
Fetching package metadata: ....
src_prefix: '/home/alistair/anaconda'
dst_prefix: '/home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev'
Packages: 165
Files: 32
Linking packages ...
[      COMPLETE      ]|#####################################################| 100%
#
# To activate this environment, use:
# $ source activate matplotlib-dev
#
# To deactivate this environment, use:
# $ source deactivate
#
~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev           /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                  *  /home/alistair/anaconda

此时我已经创建了一个 matplotlib-dev 环境，但我还没有激活它，所以安装任何新包仍然会修改我的 root 环境。

~$ source activate matplotlib-dev
discarding /home/alistair/anaconda/bin from PATH
prepending /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin to PATH

(matplotlib-dev)~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev        *  /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                     /home/alistair/anaconda

在任何情况下，直接使用 setuptools（即 python setup.py install 或 python setup.py develop）是 no longer recommended, and might not be supported by future versions of numpy etc.。

首选方法是使用 pip install <path>，如果您想要 "editable" 安装（类似于 python setup.py develop 给您的安装），则使用 pip install -e <path>：

(matplotlib-dev)~$ pip install -e git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
Obtaining matplotlib from git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
  Cloning git://github.com/matplotlib/matplotlib.git to ./src/matplotlib
...
Installing collected packages: matplotlib
  Running setup.py develop for matplotlib
Successfully installed matplotlib-1.5.0+337.g595868a

(matplotlib-dev)~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.5.0.post337+g595868a

(matplotlib-dev)~$ source deactivate
discarding /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin from PATH

~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.4.3

注意 #egg= part，它告诉 pip 将源安装到 ./src/matplotlib-dev。如果您已经有了当前正在处理的本地副本，您还可以将 pip 路径传递给本地源目录，而不是 git URI。

也应该可以使用 conda develop <path> 而不是 pip install -e <path>，尽管 conda 似乎不像 pip 那样提供集成的 VCS 支持。

在 Anaconda 中安装 Python 模块的开发版本的最佳做法是什么？

What's the best practice for installing development versions of Python modules in Anaconda?

python

git

distutils

anaconda

conda