将 C++ 包装到 python 的 Swig 使用默认值 Python 而不是 Mac OS X 中的 Anaconda python

Question

我正在尝试使用 swig 将 C++ 函数包装到 python 中。我正在使用以下命令

swig -c++ -python helloworld.i
g++ -O2 -fPIC -c hello.cpp
g++ -O2 -fPIC -c helloworld_wrap.cxx -I//anaconda/include/python2.7
g++ -lpython -dynamclib hello.o helloworld_wrap.o -o _helloworld.so

hello.cpp 是带有函数的初始文件，helloworld.i 是带有包装器的文件。这些命令创建了库 helloworld，但我只能通过 /usr/bin/python

中的默认 python 导入它

如果我尝试通过通过 anaconda 安装的 python 导入它，它会出现以下错误：

Fatal Python error: PyThreadState_Get: no current thread
Abort trap: 6

你能告诉我如何用来自 anaconda 的 python 包装代码吗？

找到解决方案：Python.h not found using swig and Anaconda Python

在上面的问题中，最上面的答案给出了使用 disutils 和 python 中的设置文件来构建库的解释。这创造了奇迹:)

我遇到的下一个问题是包装简单 class：

我的 class 来自 [示例] 的代码 (http://web.mit.edu/svn/src/swig-1.3.25/Examples/python/class/index.html)

/* File : example.h */

class Shape {
public:
  Shape() {
    nshapes++;
  }
  virtual ~Shape() {
    nshapes--;
  };
  double  x, y;   
  void    move(double dx, double dy);
  virtual double area() = 0;
  virtual double perimeter() = 0;
  static  int nshapes;
};

class Circle : public Shape {
    private:
  double radius;
public:
  Circle(double r) : radius(r) { };
  virtual double area();
  virtual double perimeter();
};

class Square : public Shape {
private:
  double width;
public:
  Square(double w) : width(w) { };
  virtual double area();
  virtual double perimeter();
};

我的 setup.py 文件：

#setup.py file:

from setuptools import setup, Extension

setup(name='example',

    version='0.1',

    ext_modules=[Extension('_example', ['example.h', 'example.i'],
                swig_opts=['-c++'],
                )],

    )

我用来包装的代码：

python setup.py build_ext --inplace

错误信息：

running build_ext
building '_example' extension
swigging example.i to example_wrap.cpp
swig -python -c++ -o example_wrap.cpp example.i
error: unknown file type '.h' (from 'example.h')

你能指出这里出了什么问题吗？我想它不能识别“.h”文件，但因为它是头文件，所以我认为它可以保持原样。另外，我的 setup.py 文件是否正确？我只是想按照示例进行简单包装，显然网上没有简单的教程。
我也可以在其他不同的问题上问这个问题，但我想现在就在这里继续。

Answer 1

Warren Weckesser 在类似问题中的回答。我按照答案中的建议使用了 setup.py 文件，并将库的路径添加到 sys.path 并且效果很好:)

在 gcc 命令中使用选项 -I/Users/myuser/anaconda/include/python2.7。（假设您使用的是 python 2.7。更改名称以匹配您正在使用的 python 版本。）您可以使用命令 python-config --cflags 获取全套推荐编译旗帜：

$ python-config --cflags
-I/Users/myuser/anaconda/include/python2.7 -I/Users/myuser/anaconda/include/python2.7 -fno-strict-aliasing -I/Users/myuser/anaconda/include -arch x86_64 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes

但是，要构建扩展模块，我建议使用简单的设置脚本，例如下面的 setup.py，让 distutils 为您找出所有的编译和链接选项。

# setup.py

from distutils.core import setup, Extension


example_module = Extension('_example', sources=['example_wrap.c', 'example.c'])

setup(name='example', ext_modules=[example_module], py_modules=["example"])

那你可以运行:

$ swig -python example.i
$ python setup.py build_ext --inplace

（查看当 setup.py 为运行时回显到终端的编译器命令。）

distutils 了解 SWIG，因此您可以在源文件列表中包含 example.i 而不是包含 example_wrap.c，并且 swig 将是运行由设置脚本自动执行：

# setup.py

from distutils.core import setup, Extension


example_module = Extension('_example', sources=['example.c', 'example.i'])

setup(name='example', ext_modules=[example_module], py_modules=["example"])

使用setup.py以上版本，您可以通过单个命令构建扩展模块

$ python setup.py build_ext --inplace

构建扩展模块后，您应该可以在 python:

中使用它

>>> import example
>>> example.fact(5)
120

如果您不想使用脚本 setup.py，这里有一组对我有用的命令：

$ swig -python example.i
$ gcc -c -I/Users/myuser/anaconda/include/python2.7 example.c example_wrap.c 
$ gcc -bundle -undefined dynamic_lookup -L/Users/myuser/anaconda/lib example.o example_wrap.o -o _example.so

注意：我正在使用 Mac OS X 10.9.4:

$ gcc --version
Configured with: --prefix=/Library/Developer/CommandLineTools/usr --with-gxx-include-dir=/usr/include/c++/4.2.1
Apple LLVM version 5.1 (clang-503.0.40) (based on LLVM 3.4svn)
Target: x86_64-apple-darwin13.3.0
Thread model: posix

将 C++ 包装到 python 的 Swig 使用默认值 Python 而不是 Mac OS X 中的 Anaconda python

Swig wrapping C++ to python is using default Python rather than Anaconda python in Mac OS X

python

macos

swig