Dask DataFrame：对具有多行的 groupby 对象重新采样

Question

我从 Castra 创建了以下 dask 数据框：

import dask.dataframe as dd

df = dd.from_castra('data.castra', columns=['user_id','ts','text'])

产量：

                      user_id / ts                  / text
ts
2015-08-08 01:10:00   9235      2015-08-08 01:10:00   a
2015-08-08 02:20:00   2353      2015-08-08 02:20:00   b
2015-08-08 02:20:00   9235      2015-08-08 02:20:00   c
2015-08-08 04:10:00   9235      2015-08-08 04:10:00   d
2015-08-08 08:10:00   2353      2015-08-08 08:10:00   e

我想做的是：

按 user_id 和 ts
在 3 小时内重新采样
在重采样步骤中，任何合并的行都应连接文本

示例输出：

                                text
user_id   ts
9235      2015-08-08 00:00:00   ac
          2015-08-08 03:00:00   d
2353      2015-08-08 00:00:00   b
          2015-08-08 06:00:00   e

我尝试了以下方法：

df.groupby(['user_id','ts'])['text'].sum().resample('3H', how='sum').compute()

并出现以下错误：

TypeError: Only valid with DatetimeIndex, TimedeltaIndex or PeriodIndex

我尝试在管道中传递 set_index('ts')，但它似乎不是 Series 的属性。

关于如何实现这一点有什么想法吗？

TL;DR

如果这能让问题更简单，我也可以更改我创建的 Castra DB 的格式。我目前的实现主要取自 this 伟大的 post.

我设置索引（在to_df()函数中）如下：

df.set_index('ts',drop=False,inplace=True)

并且拥有：

  with BZ2File(os.path.join(S.DATA_DIR,filename)) as f:
     batches = partition_all(batch_size, f)
     df, frames = peek(map(self.to_df, batches))
     castra = Castra(S.CASTRA, template=df, categories=categories)
     castra.extend_sequence(frames, freq='3h')

这里是生成的数据类型：

ts                datetime64[ns]
text                      object
user_id                  float64

Answer 1

尝试将您的索引转换为 DatetimeIndex，如下所示：

import datetime
# ...
df.index = dd.DatetimeIndex(df.index.map(lambda x: datetime.datetime.strptime(x, '%Y-%m-%d %H:%M:%S')))
# ...

Answer 2

如果我们可以假设每个 user-id 组都可以放入内存，那么我建议使用 dask.dataframe 进行外部分组，然后使用 pandas 在每个组中进行操作组，如下所示。

def per_group(blk):
    return blk.groupby('ts').text.resample('3H', how='sum')

df.groupby('user_id').apply(per_group, columns=['ts', 'text']).compute()

这将两个困难的事情分离到两个不同的项目中

dask.dataframe
在每个组内进行复杂的日期时间重采样由 pandas 明确处理。

理想情况下 dask.dataframe 会自动为您编写每组函数。目前 dask.dataframe 不智能处理多索引，或在多列 groupbys 之上重采样，因此自动解决方案尚不可用。不过，很有可能退回到 pandas 进行每块计算，同时仍然使用 dask.dataframe 相应地准备组。

Dask DataFrame：对具有多行的 groupby 对象重新采样

Dask DataFrame: Resample over groupby object with multiple rows

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