将数据以文本文件的形式放在列表或名声中
Put the data in text file on the list or fame
有一些数据(蛋白质ID),对于example:P91913 P0DM41 Q93573 P49197.I想下载http://www.uniprot.org中的序列信息,现在我可以下载一个,但我想下载许多。当我获得 .fasta 时,每个 url 仅在 ID 上不同。所以,我想把这些ID放到一个list或者frame中,然后通过ID一个一个的one.Now把这些ID放在一个文本文件中,如果想用looping语句一个一个的访问ID怎么办获取不同ID的序列信息。提前致谢!
x <- c("P91913", "P0DM41", "Q93573", "P49197")
y <- sapply(x, function(i) {
url <- paste("http://www.uniprot.org/uniprot/", i, ".fasta", sep="")
return(readLines(url))
})
writeLines(unlist(y), "E:\qq.txt")
有一些数据(蛋白质ID),对于example:P91913 P0DM41 Q93573 P49197.I想下载http://www.uniprot.org中的序列信息,现在我可以下载一个,但我想下载许多。当我获得 .fasta 时,每个 url 仅在 ID 上不同。所以,我想把这些ID放到一个list或者frame中,然后通过ID一个一个的one.Now把这些ID放在一个文本文件中,如果想用looping语句一个一个的访问ID怎么办获取不同ID的序列信息。提前致谢!
x <- c("P91913", "P0DM41", "Q93573", "P49197")
y <- sapply(x, function(i) {
url <- paste("http://www.uniprot.org/uniprot/", i, ".fasta", sep="")
return(readLines(url))
})
writeLines(unlist(y), "E:\qq.txt")