根据 ImageJ 宏中的文件名结尾设置不同的阈值

Question

我有一个包含很多图像的文件夹。这些图像被分成三组图像，其中一个文件名以 dsRed).tif 结尾，另一个文件名以 FITC).tif 结尾，另一个文件名以 DAPI).tif.

结尾

我如何告诉 ImageJ 根据每个图像的文件名结尾做不同的事情？

我已尝试将宏设置为运行不同的阈值，例如：

//run("Brightness/Contrast...");
setMinAndMax(0, 20000);
close();

基于此处找到的脚本的不同文件名： http://imagej.1557.x6.nabble.com/open-file-with-specific-partial-name-td5002910.html 和这里： http://rsb.info.nih.gov/ij/macros/Batch_RGB_Merge.txt 但如果 else 对我的三个文件名结尾起作用，我在格式化时遇到了问题。

Answer 1

您可以使用后续 if ... else 语句检查文件名：

if (endsWith(filename,"dsRed).tif") {
    // do dsRed processing here
} else if (endsWith(filename,"FITC).tif") {
    // do FITC processing here
} else if (endsWith(filename,"DAPI).tif") {
    // do DAPI processing here
}

如果您想对包含相同基本名称的文件进行分组，请仅在您的一个频道（例如 dsRed）上循环并使用 replace:

replace(filename, "dsRed).tif", "FITC).tif");

在每次循环迭代中处理相应的其他通道。

根据 ImageJ 宏中的文件名结尾设置不同的阈值

Setting different thresholds dependent on what filename ends with in ImageJ macro

imagej

imagej-macro