MPI_Gather 我可能会看到

Question

N是4，N_glob也是。它恰好大小相同。 p 是 4。

这是代码的一小部分：

float **global_grid;
float **gridPtr; 
lengthSubN = N/pSqrt;
subN = lengthSubN + 2;
grid = allocate2D(grid, subN, subN);
..
MPI_Type_contiguous(lengthSubN, MPI_FLOAT, &rowType);
MPI_Type_commit(&rowType);
..
gridPtr = grid;
..
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
if(id == 0) {
    global_grid = allocate2D(global_grid, N_glob, N_glob);
}
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
MPI_Gather(&(gridPtr[0][0]), 1, rowType,
           &(global_grid[0][0]), 1, rowType, 0, MPI_COMM_WORLD);
MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
if(id == 0)
    print(global_grid, N_glob, N_glob);

我有 p 个子矩阵，我试图将它们全部收集到根进程中，全局矩阵在其中等待它们。但是，它只会抛出一个错误，有什么想法吗？

我收到一个段错误：

BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES PID 29058 RUNNING AT linux16 EXIT CODE: 139 YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Segmentation fault (signal 11)

编辑：

我发现了这个问题 MPI_Gather segmentation fault 并且我将 global_grid 初始化为 NULL，但没有成功。但是，如果我这样做：

//if(id == 0) {
    global_grid = allocate2D(global_grid, N_glob, N_glob);
//}

然后一切正常。但是全局矩阵不应该只存在于根进程中吗？

EDIT_2:

如果我这样做：

if(id == 0) {
    global_grid = allocate2D(global_grid, N_glob, N_glob);
} else {
    global_grid = NULL;
}

那么这里会崩溃:

MPI_Gather(&gridPtr[0][0], 1, rowType,
                global_grid[0], 1, rowType, 0, MPI_COMM_WORLD);

Answer 1

变量global_grid在等级0以外的等级中没有被初始化。因此，这个等式

&(global_grid[0][0])

或这个：

global_grid[0]

导致分段错误，因为它试图访问 global_grid 的第一个元素。

只需调用两次 MPI_Gather，一次用于等级 0，一次用于其他等级：

if(id == 0) {
    MPI_Gather(gridPtr[0], 1, rowType, global_grid[0], 1, rowType, 0, MPI_COMM_WORLD);
} else {
    MPI_Gather(gridPtr[0], 1, rowType, NULL, 0, rowType, 0, MPI_COMM_WORLD);
}

MPI_Gather 我可能会看到

MPI_Gather 2D array

c

parallel-processing

mpi

send

distributed-computing