更改 R 中的列标题,交替使用空格和名称(对于 genalex 格式)
Change column headings in R, with alternating blanks and names (for genalex format)
我有一个名为 genalex
的数据框,因为我正试图将我的遗传数据放入通用的 "genalex" 格式。我刚刚在 R 中使用了 strsplit
函数来拆分列,现在我有了这个:
> genalex[1:5,1:10]
Ind V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9
1 100 A A C C N N C C N
2 101 A A C C N N N N N
3 10 A A C C N N C C N
4 11 A A N N N N C C N
5 12 N N N N N N C C G
这个数据框实际上有 330 行和 32,068 列。我想用新名称替换所有其他列(V1、V3、V5、V7、V9 等)的名称。我还想删除所有其他列名称(V2、V4、V6、V8 等)
对于新的列名,我想在拆分列之前使用旧数据框中的列名。我将调用旧数据框 table
。此数据框有 16,034 列,因为它不包括 spaces:
table[1:5,1:5]
X X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A C N C
2 101 A C N N
3 10 A C N C
4 11 A N N C
5 12 N N N C
因此,使用 table
中的旧列名称,然后在每列之间添加一个 space,我最终希望我的数据框看起来像这样,对于所有 32,068 列:
> genalex[1:5,1:8]
Ind X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A A C C N N C
2 101 A A C C N N N
3 10 A A C C N N C
4 11 A A N N N N C
5 12 N N N N N N C
感谢您的帮助。
您可以使用seq
函数获取奇数和偶数位置:
names(genalex)[seq(2,ncol(genalex),2)] <- names(table)
names(genalex)[seq(1,ncol(genalex),2)] <- ""
names(genalex)[1] <- "Ind"
第一行使用 table 中的列名重命名所有 even-numbered 列索引 (2,4,6,...),第二行设置所有 odd-numbered列索引为空。然后将第一列重命名为 "Ind".
我有一个名为 genalex
的数据框,因为我正试图将我的遗传数据放入通用的 "genalex" 格式。我刚刚在 R 中使用了 strsplit
函数来拆分列,现在我有了这个:
> genalex[1:5,1:10]
Ind V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9
1 100 A A C C N N C C N
2 101 A A C C N N N N N
3 10 A A C C N N C C N
4 11 A A N N N N C C N
5 12 N N N N N N C C G
这个数据框实际上有 330 行和 32,068 列。我想用新名称替换所有其他列(V1、V3、V5、V7、V9 等)的名称。我还想删除所有其他列名称(V2、V4、V6、V8 等)
对于新的列名,我想在拆分列之前使用旧数据框中的列名。我将调用旧数据框 table
。此数据框有 16,034 列,因为它不包括 spaces:
table[1:5,1:5]
X X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A C N C
2 101 A C N N
3 10 A C N C
4 11 A N N C
5 12 N N N C
因此,使用 table
中的旧列名称,然后在每列之间添加一个 space,我最终希望我的数据框看起来像这样,对于所有 32,068 列:
> genalex[1:5,1:8]
Ind X446043 X539052 X614054 X683054
1 100 A A C C N N C
2 101 A A C C N N N
3 10 A A C C N N C
4 11 A A N N N N C
5 12 N N N N N N C
感谢您的帮助。
您可以使用seq
函数获取奇数和偶数位置:
names(genalex)[seq(2,ncol(genalex),2)] <- names(table)
names(genalex)[seq(1,ncol(genalex),2)] <- ""
names(genalex)[1] <- "Ind"
第一行使用 table 中的列名重命名所有 even-numbered 列索引 (2,4,6,...),第二行设置所有 odd-numbered列索引为空。然后将第一列重命名为 "Ind".