有没有办法从 ELKI 将可达性列表输入 Optics Xi 并获取集群？
Is there a way to input a reachability list into Optics Xi from ELKI and get clusters?
我在通过 Optics 算法将数据正确输入 ELKI 运行 时遇到了一些麻烦，但是使用 Optics 的 R 实现，我可以轻松获得可达距离列表。我可以将它们写入这样的文件。 （索引，距离）
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3 0.9
...
我想找到由局部最小值分隔的集群。我认为 ELKI 软件中的 Optics Xi 算法可以做到这一点，但由于我在导入数据时遇到问题，我无法使用它。
使用 Optics 论文中的伪代码用另一种语言编写 Optics 聚类提取算法会更容易吗？我认为最基本的是，当它们彼此相邻时，它只是将索引聚集在一起，并且不会减少到新的局部最小值。
谢谢
您可以尝试实现接口 OPTICSTypeAlgorithm, which largely means reading your data and storing it in an object of type ClusterOrder。
但是，ELKI 包含一个稍微高级的 OPTICS 版本，使用 OPTICSXi 会产生更好的结果。详细信息最终将作为技术报告发布。您从 R 实现中获得的数据不足以校正 OPTICS 图中的一些常见伪影。
请使用ELKI中的OPTICS版本。尝试 Cover 树索引（它非常快速且易于使用）。避免在输入数据中使用 ID 列，或告诉解析器哪一列是 ID 列。
我在通过 Optics 算法将数据正确输入 ELKI 运行 时遇到了一些麻烦，但是使用 Optics 的 R 实现，我可以轻松获得可达距离列表。我可以将它们写入这样的文件。 （索引，距离）
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我想找到由局部最小值分隔的集群。我认为 ELKI 软件中的 Optics Xi 算法可以做到这一点，但由于我在导入数据时遇到问题，我无法使用它。
使用 Optics 论文中的伪代码用另一种语言编写 Optics 聚类提取算法会更容易吗？我认为最基本的是，当它们彼此相邻时，它只是将索引聚集在一起，并且不会减少到新的局部最小值。
谢谢
您可以尝试实现接口 OPTICSTypeAlgorithm, which largely means reading your data and storing it in an object of type ClusterOrder。
但是，ELKI 包含一个稍微高级的 OPTICS 版本，使用 OPTICSXi 会产生更好的结果。详细信息最终将作为技术报告发布。您从 R 实现中获得的数据不足以校正 OPTICS 图中的一些常见伪影。
请使用ELKI中的OPTICS版本。尝试 Cover 树索引（它非常快速且易于使用）。避免在输入数据中使用 ID 列，或告诉解析器哪一列是 ID 列。