使用 gather 时保留许多列

Question

我有一个非常宽的 df（85 列），我想使用 gather 将其转换为长格式。我没有使用 -c(all the columns I do not want to gather) 语法来保留列，而是创建了列名的对象并得到了错误。

Error in -c(KeepThese) : invalid argument to unary operator

例如，使用 iris 和一些额外的字段

require(tidyr)
iris$Season <- sample(c("AAA", "BBB"), nrow(iris), replace = T)
iris$Var <- sample(c("CCC", "DDD"), nrow(iris), replace = T)

> head(iris)
  Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species Season Var
1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa    AAA DDD
2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa    AAA CCC
3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa    BBB CCC
4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa    BBB CCC
5          5.0         3.6          1.4         0.2  setosa    BBB DDD
6          5.4         3.9          1.7         0.4  setosa    AAA DDD

我想收集除5:7以外的所有列，在下面做成一个对象。

KeepThese <- colnames(iris)[5:7]

现在，我想 gather 除 5:7 之外的所有列并调用 ID 列 Part 和数字字段 Value 并使用以下代码并得到错误。

dat <- iris %>% gather(Part, Value, -c(KeepThese))


Error in -c(KeepNames) : invalid argument to unary operator

如果不在 tidyr 中逐一写出，如何指定一堆我不想收集的列？

ADDITION 为什么我的代码不起作用？

Answer 1

您可以使用 match（或首先将列号传递给 gather）：

dat <- iris %>% gather(Part, Value, -(match(KeepThese, colnames(.))))
head(dat)

##   Species Season Var         Part Value
## 1  setosa    BBB DDD Sepal.Length   5.1
## 2  setosa    AAA CCC Sepal.Length   4.9
## 3  setosa    BBB CCC Sepal.Length   4.7
## 4  setosa    AAA CCC Sepal.Length   4.6
## 5  setosa    BBB DDD Sepal.Length   5.0
## 6  setosa    BBB CCC Sepal.Length   5.4

Answer 2

更新答案： 正如 Hadley 在评论中指出的那样，one_of() 就是您想要的。

dat <- iris %>% gather(Part, Value, -one_of(KeepThese))

原答案：

另一种选择是使用 as.name()。我们可以根据要保留的列名创建一个名称分类对象列表。然后用do.call(c, ...)插入到gather().

dat <- iris %>% gather(Part, Value, -do.call("c", lapply(KeepThese, as.name)))
head(dat)
#   Species Season Var         Part Value
# 1  setosa    AAA CCC Sepal.Length   5.1
# 2  setosa    AAA CCC Sepal.Length   4.9
# 3  setosa    AAA DDD Sepal.Length   4.7
# 4  setosa    AAA CCC Sepal.Length   4.6
# 5  setosa    AAA CCC Sepal.Length   5.0
# 6  setosa    AAA DDD Sepal.Length   5.4

或者，一个简单的 %in% 和 which() 也可以做到这一点（与 jbaums 的回答非常相似）。

iris %>% gather(Part, Value, -which(names(.) %in% KeepThese))

Answer 3

指定列 -matches 和一个好的正则表达式工作

dat <- iris %>% gather(Part, Value, -matches(paste(KeepThese, collapse="|")))

使用 gather 时保留许多列

Preserving many columns when using gather

r

tidyr