Python 词典列表词典

Question

我希望能够从文件中访问数据，将它们组织成一个我认为应该是字典列表的结构，据我了解，可能如下所示：

ID_FILE = { 
        'KEY_1': [
                    {
                        'R_1': [
                                {
                                    'A_1': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_2': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_3': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ]
                                }
                            ],
                        'R_2': [
                                {
                                    'A_1': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_2': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_3': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ]
                                }
                        ],
                        'R_3': [
                                {
                                    'A_1': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_2': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ],
                                    'A_3': [
                                            {
                                                'P_1': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_2': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            },
                                            {
                                                'P_3': ['a', 'b', 'c', 'd']
                                            }
                                        ]
                                }
                        ]
                    }
                ],

        'KEY_2': [...as 'KEY_1'...],

        'KEY_3': [...as 'KEY_1'...]
    }

我不知道它是否正确，但实际上我可以使用 ['ID_FILE']['KEY_1']['R_2']['A_3']['P_2'].b 之类的命令访问字典的数据，例如（使用方括号 select 字典的键，以及括号外所需值的点）以了解 P_2 键的 b 值，对于 KEY_1 的 R_2 中的 A_3，或['ID_FILE']['KEY_1'].R_2得到一个列表['A_1', 'A_2' , 'A_3']，也就是select字典的键，最后表示需要的信息，得到最终的输出...

结构比较复杂，但是概念是可以概括的，我会理解用什么方法，python模块或者最佳方法，我可以在python中实现；是从外入手还是从内入手，将词典整理拼接成独一无二的大词典...

编辑1：即使用上一个键的值作为新子字典的键。

编辑2：源文件是一个CIF文件，如this（这是一个有170925行的大文件）。考虑到那个 cif 文件，我正在分析以 ATOM 开头的行，将它们分成几列：

KEY = column 6
R = column 8
A = column 3
P = Atom row = list of columns
a = column 1
b = column 2
c = column 3
d = column 4

因此，例如，要获取链 A（第 6 列）的残基 271（第 8 列）的原子 N（第 3 列）的 x 坐标（第 10 列），请给出这样的命令 ['4tvx' ]['A']['271']['N'].coordX

Answer 1

您的模式似乎不太理想（尽管在不了解您存储的内容的情况下很难判断）。通过查看您的数据，KEY_1、R_1 和 A_1 应该是字典而不是列表。通过简化结构，您将使用 [ID_FILE][KEY_1][R_2][A_3][P_2].b

Answer 2

感谢 Steven Rumbalski 向我指出该工具，PyCifRW，但是，回答我的主题问题，需要的结构是字典的字典，以实现该目标：

r_list = ['20', '21']
dictionary = {}
r_dict = {}
a_dict = {}
for r in range(0,len(r_list)):
    r = r_list[r]
    dictionary['C'] = r_dict
    r_dict[r] = a_dict

print dictionary
print dictionary['C']

"""output:

{'C': {'20': {}, '21': {}}}
{'20': {}, '21': {}}

equal to:

dictionary = {'C': {
                    '20': {},
                    '21': {}
                }
            }
"""

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