X-chromosome 个祖先的 Neo4j 密码查询

Question

在遗传系谱学中 X-chromosome 数据可用于链接某些祖先。这在以下位置得到了很好的说明：X-DNA Inheritance Chart

我的 Neo4j 数据库有每个人的节点以及连接他们的父亲和母亲的关系。每个节点都有一个属性性别（对于人的性别；M 或 F）。一位女性有两个 X-chromosome，其中一个来自 parent。男性有一个 X-chromosome，总是来自母亲。

您可以使用 reduce 查看祖先遗传中涉及的性别：

match p=(n:Person{RN:1})-[:father|mother*..20]->m 
return m.fullname as FullName
,reduce(status ='', q IN nodes(p)| status + q.sex) AS c 
order by length(p), c

所以，从男性 (RN:1) 开始，c 的结果是他父亲是 MM，他母亲是 MF，祖父是 MMM，外祖父是 MFM，等等。这个模式表明当 c 包含 MM（两个 M 依次在一起）时，这些不会对起始 Person 的 X-chromosome 做出贡献。

我想删除任何具有 MM 模式的节点。使用外部代码很容易做到这一点，但我不知道如何在密码查询中做到这一点。

Answer 1

这应该适合你：

MATCH p=(n:Person { RN:1 })-[:father|mother*..20]->m
WITH m, NODES(p) AS a
WITH m, REDUCE(c = "", i IN RANGE(0, SIZE(a)-1)| CASE
  WHEN c IS NULL OR (i > 0 AND (a[i-1]).sex = "M" AND (a[i]).sex = "M") THEN
    NULL
  ELSE
    c + (a[i]).sex
  END ) AS c
WHERE c IS NOT NULL
RETURN m.fullName AS fullName, c
ORDER BY LENGTH(c);

和 here is a console 证明了结果。

Answer 2

晚会有点晚了，思考过程与@cybersam 的解决方案相同。

match p=(n:Person { RN: 1 })-[:father|mother*..20]->(m) 
with p, m, extract( g in nodes(p) | g.sex ) as genders
with p, m, genders, range(0,size(genders) -1,1) as gender_index
unwind gender_index as idx
with p, m, genders, collect([genders[idx], genders[idx+1]]) as pairs
where not ['M','M']  in pairs
return m.fullName
,reduce(status ='', q IN nodes(p)| status + q.sex) AS c 
order by length(p), c

Answer 3

这个查询只让我得到了贡献 X 染色体的祖先：

match p=(n:Person{RN:1})-[:father|mother*..20]->(m)     
with m, reduce(status ='', q IN nodes(p)| status + q.sex) AS c     
where c=replace(c,'MM','') 
return m.RN,m.fullname as Name, c

性别集合为每一代添加一个性别，并被过滤以排除任何 MM，因为男性无法将他的 X 传递给另一个男性（例如，儿子）。

X-chromosome 个祖先的 Neo4j 密码查询

Neo4j cypher query for X-chromosome ancestors

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