将在 Bokeh 0.9 中有效的堆叠条移动到 Bokeh 0.11

Question

我正在将我所有的系统从 Bokeh 0.9 更新到 Bokeh 0.11，并且有一张图表我似乎无法再工作了。

我从这样的 DataFrame 开始：

Out[75]: 
         First  Second  Third  Fourth  Fifth
Red         27      22     33      20      9
Blue        10      27     18      31     14
Magenta     32      10     11       8     10
Yellow       8       6     14      13     15
Green        9       5      6       6      2

然后我会制作一个漂亮的图表，轴上有颜色名称，5 个堆叠条的顺序与图例相同，这将给出排名。例如，这是我们在 0.9.0 中生成的具有 10 个等级和 10 个类别的堆叠条的输出：

Stacked Bar with 10 categories and 10 ranks

我过去常常这样做：

plot = Bar(dataframe, list_of_color_names, title="stack of 5 categorical ranked in order from first to last", stacked=True, legend="top_right", ylabel="count", width=600, height=600)

其中 "list_of_colors_names" 只是从 DataFrame 的索引生成的列表，但这不再有效。我意识到 0.11 下降 "stacked=True"，现在我们使用 "stack"，但我似乎仍然无法让它工作。

Bokeh 网站上的示例适用于更简单的条形图，当我将该模型应用于我的 DataFrame 时，我遇到了各种错误，例如“'NoneType' 对象不可迭代”，但我显然只是缺少关于这种类型的堆叠条在 0.11 中如何工作的大图。这里还有一些其他的 Bokeh 堆叠条讨论，但它们要么是针对较早版本的 Bokeh（我的代码在 0.9 中运行），要么似乎是不同的情况。现在做这种堆叠条最好的方法是什么？

Answer 1

我不知道这是否是唯一的方法，但如果您将 所有数据放在一列 中，Bokeh 0.11 中的堆叠条形图就可以工作，而不是在矩阵中。然后，您需要在相应的数据框列中提供矩阵行和列索引，在下面的示例代码中称为 nr 和 rank。这些在调用 Bar 方法时被引用，其中 "stack" 应引用矩阵示例中的列。

import pandas as pd
from bokeh.charts import Bar, show

all_data={
'nr':  [1,2,3,4,5,
        1,2,3,4,5,
        1,2,3,4,5,
        1,2,3,4,5,
        1,2,3,4,5],
'rank':['First','First','First','First','First',
       'Second','Second','Second','Second','Second',
       'Third','Third','Third','Third','Third',
       'Fourth','Fourth','Fourth','Fourth','Fourth',
       'Fifth','Fifth','Fifth','Fifth','Fifth'],
'data':[27,10,32,8,9,
        22,27,10,6,5,
        33,18,11,14,6,
        20,31,8,16,6,
        9,14,10,15,2]
      }
df=pd.DataFrame(all_data)

p=Bar(df,label='nr',values='data',stack='rank',legend='top_right')
show(p)

评论：标准条形图调色板只有六种颜色，如您的 10 等级示例所示。我使用下面的代码片段（改编自其他代码片段）来生成条形图所需的尽可能多的不同颜色。它使用 matplotlib colormap 颜色图作为输入。

import matplotlib.cm as cm
import numpy as np

colormap =cm.get_cmap("jet")
different_colors=10
color_mapping=colormap(np.linspace(0,1,different_colors),1,True)
bokeh_palette=["#%02x%02x%02x" % (r, g, b) for r, g, b in color_mapping[:,0:3]]

p=Bar(df,label='nr',values='data',stack='rank',legend='top_right',palette=bokeh_palette)
show(p)

这是讨论如何选择的好页面 matplotlib colormaps。

将在 Bokeh 0.9 中有效的堆叠条移动到 Bokeh 0.11

Moving a stacked bar that that worked in Bokeh 0.9 to Bokeh 0.11

python-2.7

bokeh

stacked-chart