如何在 cran R 的 3d 图中找到置信区间?
How to find confidence interval in 3d plots in cran R?
我在 cran R 中绘制了这个 3d 图
rb = rep(seq(0.1, 1, 0.1), 10)
ro = sort(rb)
lods = runif(100) #create a random LOD score
library(scatterplot3d)
lodsplot<- scatterplot3d(rb, ro, lods)
我使用 max(lods) 找到了 LOD 分数的最大值,因此找到了相应的 rb 和 ro。现在,我想找到 rb 和 ro 的 95% CI。假设 max(lods) = 0.8 并且各自的 rb 和 ro 分别为 0.2 和 0.3,我想到使用以下方法绘制平面:
lodsplot$plane3d(c(0.2, 0.3, 0.8))
然后找到平面上方的点(我不知道该怎么做)。我的想法正确吗?谢谢!
注:
如果我只是做一个二维图,我会这样做:
plot(rb, lods, type = "l)
which(lods == max(lods))
limit = max(lods) - 1.92
abline(h = limit)
#Find intersect points:
above <- lr > limit
intersect.points <- which(diff(above) != 0)
您需要找到平面上方的点来定义假设的 95% 上限,您建议使用以下方程式:
lods = 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro
所以计算满足隐式不等式的点的项目编号:
high <- which(lods > 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro)
和情节:
png()
lodsplot<- scatterplot3d(rb, ro, lods)
high <- which(lods > 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro)
lodsplot$plane3d(c(0.2, 0.3, 0.8))
lodsplot$points3d( rb[high], ro[high], lods[high], col="red"); dev.off()
请注意,scatterplot3d 中的 plane3d 函数也接受 lm 或 glm 的结果,因此您可以先计算模型 lods ~ rb +ro
,然后使用 predict( ..., type="response")
和颜色计算 95% 的预测表面使用此方法的点。请参阅:predict and multiplicative variables / interaction terms in probit regressions 了解在公认的更复杂模型上的等效程序的工作示例。
您还可以在 [r] prediction surface
上进行搜索并找到其他可能有用的答案,例如 BenBolker 建议使用 rgl:"A: scatterplot3d for Response Surface in R"
我在 cran R 中绘制了这个 3d 图
rb = rep(seq(0.1, 1, 0.1), 10)
ro = sort(rb)
lods = runif(100) #create a random LOD score
library(scatterplot3d)
lodsplot<- scatterplot3d(rb, ro, lods)
我使用 max(lods) 找到了 LOD 分数的最大值,因此找到了相应的 rb 和 ro。现在,我想找到 rb 和 ro 的 95% CI。假设 max(lods) = 0.8 并且各自的 rb 和 ro 分别为 0.2 和 0.3,我想到使用以下方法绘制平面:
lodsplot$plane3d(c(0.2, 0.3, 0.8))
然后找到平面上方的点(我不知道该怎么做)。我的想法正确吗?谢谢!
注:
如果我只是做一个二维图,我会这样做:
plot(rb, lods, type = "l)
which(lods == max(lods))
limit = max(lods) - 1.92
abline(h = limit)
#Find intersect points:
above <- lr > limit
intersect.points <- which(diff(above) != 0)
您需要找到平面上方的点来定义假设的 95% 上限,您建议使用以下方程式:
lods = 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro
所以计算满足隐式不等式的点的项目编号:
high <- which(lods > 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro)
和情节:
png()
lodsplot<- scatterplot3d(rb, ro, lods)
high <- which(lods > 0.2+ 0.3*rb+ 0.8*ro)
lodsplot$plane3d(c(0.2, 0.3, 0.8))
lodsplot$points3d( rb[high], ro[high], lods[high], col="red"); dev.off()
请注意,scatterplot3d 中的 plane3d 函数也接受 lm 或 glm 的结果,因此您可以先计算模型 lods ~ rb +ro
,然后使用 predict( ..., type="response")
和颜色计算 95% 的预测表面使用此方法的点。请参阅:predict and multiplicative variables / interaction terms in probit regressions 了解在公认的更复杂模型上的等效程序的工作示例。
您还可以在 [r] prediction surface
上进行搜索并找到其他可能有用的答案,例如 BenBolker 建议使用 rgl:"A: scatterplot3d for Response Surface in R"