批量处理 GC-MS 数据
Process GC-MS data in batch
这是我的问题。
我的实验室有一台 GC-MS(气相色谱-质谱联用仪)设备,可以每小时检测挥发性有机化合物 (VOC) 的浓度。
所以,随着时间的积累,我有这么多每小时的数据(.qgd格式。)都包含了将近100个物种的面积,Height, Conc, Ret.time,等用预构建的方法。
我现在的目标是为每个文件(一年 = 8760 个文件)裁剪每个物种的浓度。这是一项相当繁重的工作。
有没有人对海量实验数据只能通过特定软件打开的熟悉经验?
有没有什么方法可以批量处理这些文件?
PS:我熟悉 Python 语言。 Python要是能达到就好了!
根据功能概述,OPENChrom确实支持导入岛津专有 QGD 格式的文件。
如果这不能直接起作用,您可以先尝试使用供应商软件将原始数据导出为一些(更多)记录的文件格式,例如 JCAMP-DX、netCDF 或 mzML
这是我的问题。
我的实验室有一台 GC-MS(气相色谱-质谱联用仪)设备,可以每小时检测挥发性有机化合物 (VOC) 的浓度。
所以,随着时间的积累,我有这么多每小时的数据(.qgd格式。)都包含了将近100个物种的面积,Height, Conc, Ret.time,等用预构建的方法。
我现在的目标是为每个文件(一年 = 8760 个文件)裁剪每个物种的浓度。这是一项相当繁重的工作。
有没有人对海量实验数据只能通过特定软件打开的熟悉经验?
有没有什么方法可以批量处理这些文件?
PS:我熟悉 Python 语言。 Python要是能达到就好了!
根据功能概述,OPENChrom确实支持导入岛津专有 QGD 格式的文件。
如果这不能直接起作用,您可以先尝试使用供应商软件将原始数据导出为一些(更多)记录的文件格式,例如 JCAMP-DX、netCDF 或 mzML